More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2213 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  95.63 
 
 
206 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  90.78 
 
 
206 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  89.32 
 
 
206 aa  370  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  90.29 
 
 
206 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  85.92 
 
 
206 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  76.7 
 
 
206 aa  319  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  75.73 
 
 
206 aa  315  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.1 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.1 
 
 
231 aa  230  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.91 
 
 
231 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.67 
 
 
231 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.46 
 
 
231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.86 
 
 
231 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  52.86 
 
 
231 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.37 
 
 
215 aa  216  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  52 
 
 
257 aa  205  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  53.05 
 
 
228 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  51.98 
 
 
208 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.68 
 
 
257 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.04 
 
 
248 aa  188  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  46.78 
 
 
833 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  50.24 
 
 
247 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  44.74 
 
 
836 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  44.69 
 
 
878 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  82 
 
 
100 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  81 
 
 
100 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  81 
 
 
100 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  79 
 
 
100 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  81 
 
 
100 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  81 
 
 
100 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  80 
 
 
100 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  53.55 
 
 
234 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  42.74 
 
 
840 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  79 
 
 
100 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  78 
 
 
100 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  80 
 
 
100 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  84 
 
 
100 aa  161  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  79 
 
 
100 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  77 
 
 
100 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  78 
 
 
103 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  76 
 
 
100 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  80 
 
 
100 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  80 
 
 
100 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  78 
 
 
100 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  78 
 
 
100 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  76 
 
 
100 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.74 
 
 
234 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.17 
 
 
230 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  76 
 
 
100 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  73 
 
 
101 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.81 
 
 
232 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.06 
 
 
190 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  50.8 
 
 
200 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  77 
 
 
100 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  71 
 
 
101 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  71 
 
 
104 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  70 
 
 
101 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  74.75 
 
 
100 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  68 
 
 
101 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  74.75 
 
 
100 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  70.3 
 
 
101 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  72.73 
 
 
100 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  71.72 
 
 
100 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  68.69 
 
 
100 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  71.72 
 
 
100 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  67.68 
 
 
101 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  69 
 
 
100 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7012  urease gamma subunit  82.56 
 
 
86 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  68 
 
 
104 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  67 
 
 
100 aa  141  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  66 
 
 
100 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  72.73 
 
 
100 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  68.69 
 
 
100 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  65 
 
 
101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  65 
 
 
101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  70.71 
 
 
100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  66 
 
 
100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  72.73 
 
 
100 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  62 
 
 
100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  72.73 
 
 
100 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  69.7 
 
 
100 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  63.55 
 
 
112 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  65 
 
 
101 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  69.7 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  69.7 
 
 
100 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  68.69 
 
 
100 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>