More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2183 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  100 
 
 		 282 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  91.49 
 
 		 282 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  79.02 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  83.52 
 
 		 289 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  79.3 
 
 		 289 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  83.15 
 
 		 283 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  72.46 
 
 		 332 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  78.66 
 
 		 317 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  75.49 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.33 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  78.24 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  77.82 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  77.64 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  70.04 
 
 		 321 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  69.43 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  72.8 
 
 		 311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  73.22 
 
 		 279 aa  352  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  73.22 
 
 		 254 aa  352  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  73.22 
 
 		 277 aa  351  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  74.06 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  69.87 
 
 		 268 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  66.02 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  69.44 
 
 		 267 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  72.15 
 
 		 263 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  65.62 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  69.46 
 
 		 270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  67.93 
 
 		 264 aa  328  9e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  67.93 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  64.71 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  61.72 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  61.72 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  64.05 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  62.66 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  63.14 
 
 		 271 aa  311  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  60.41 
 
 		 252 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  62.98 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  62.5 
 
 		 254 aa  308  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  63.09 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  62.1 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  65.82 
 
 		 253 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  63.41 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  62.45 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  62.7 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  60.62 
 
 		 266 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  62.7 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  63.71 
 
 		 244 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  64.44 
 
 		 267 aa  305  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  63.71 
 
 		 268 aa  305  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  63.82 
 
 		 268 aa  305  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  60.87 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  60.89 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  62.45 
 
 		 253 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  60.83 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  61.36 
 
 		 264 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  60.89 
 
 		 258 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  60.42 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  61.73 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  59.61 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  60.89 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  60.48 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  63.22 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  60.48 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  64.2 
 
 		 251 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  59.92 
 
 		 240 aa  299  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  60.48 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  61.73 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  63.71 
 
 		 258 aa  298  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61.6 
 
 		 244 aa  298  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  60.48 
 
 		 258 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  60.91 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  61.32 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  62.34 
 
 		 239 aa  296  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  60.25 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  62.1 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  62.2 
 
 		 255 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  63.45 
 
 		 241 aa  295  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  64.05 
 
 		 250 aa  294  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  62.14 
 
 		 256 aa  293  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  63.18 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.98 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.33 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  61.25 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59.41 
 
 		 241 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59.41 
 
 		 241 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  59.92 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  64.71 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  60.83 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  61.76 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.4 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>