More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2123 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  292  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  94.48 
 
 		 150 aa  255  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  74.66 
 
 		 149 aa  215  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  65.49 
 
 		 155 aa  189  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  65.49 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  61.97 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  61.97 
 
 		 154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  61.97 
 
 		 154 aa  186  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  58.82 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  62.24 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 174 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0864  putative alanine catabolic operon transcriptional regulator  67.89 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  47.95 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  51.05 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  52.11 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  46.58 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  47.55 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 176 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  48.61 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  48.95 
 
 		 166 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  44.9 
 
 		 155 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 177 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.23 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  42.96 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  42.25 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 213 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  44.78 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  41.84 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 202 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 166 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.55 
 
 		 175 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.55 
 
 		 175 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.55 
 
 		 175 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.55 
 
 		 229 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.55 
 
 		 175 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>