33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2101 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  322  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  80.25 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  69.53 
 
 		 163 aa  174  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  61.78 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  60.76 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  68.99 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  37.93 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  32.69 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  33.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  37.86 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  32.35 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  41.05 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  38.71 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  29.32 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  37.14 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  38.3 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  31.88 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  35.48 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  34.02 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  30.77 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  29.55 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  27.45 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  31.58 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  34.74 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  25.83 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  34.04 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  34.92 
 
 		 165 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  34.43 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>