196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2064 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  92.74 
 
 
246 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  74.9 
 
 
244 aa  360  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  75.31 
 
 
250 aa  358  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  74.9 
 
 
250 aa  358  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  73.66 
 
 
244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  55.1 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  54.07 
 
 
255 aa  265  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  54.92 
 
 
254 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  52.07 
 
 
246 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  53.28 
 
 
254 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  53.06 
 
 
248 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  56.72 
 
 
255 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  53.25 
 
 
259 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  50.21 
 
 
257 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  50 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  48.55 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  47.3 
 
 
246 aa  221  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  46.69 
 
 
250 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  46.89 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  47.92 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  45.64 
 
 
259 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  47.58 
 
 
277 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  43.58 
 
 
259 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  45.41 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  40.16 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  44.39 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  40.73 
 
 
262 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  40.4 
 
 
262 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  40.4 
 
 
262 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  41.13 
 
 
256 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
255 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  40.4 
 
 
253 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  39.57 
 
 
235 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  40.18 
 
 
248 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
260 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  36.24 
 
 
256 aa  141  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  34 
 
 
261 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.6 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 
240 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  30.77 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  31.96 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
810 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  26.54 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  28.78 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
219 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  43.75 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
271 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  26.75 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
196 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  27.32 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  27.52 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  26.95 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  26.03 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  24.61 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  24.61 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  48.98 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
293 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  25.75 
 
 
262 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.11 
 
 
345 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  32.14 
 
 
403 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  25.86 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  33.82 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  34.67 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.52 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  25 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.5 
 
 
503 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  25 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  32.65 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  26.59 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  22.02 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  26.81 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  25.86 
 
 
270 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
270 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
270 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
270 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
270 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
272 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>