More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2042 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
291 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  79.73 
 
 
291 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  76.29 
 
 
291 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  76.29 
 
 
291 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  74.91 
 
 
291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  63.37 
 
 
278 aa  374  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  64.1 
 
 
280 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  61.68 
 
 
275 aa  347  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  58.13 
 
 
291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  60.51 
 
 
295 aa  335  5.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  58.5 
 
 
298 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  62.21 
 
 
278 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  56.12 
 
 
302 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  58.87 
 
 
275 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  56.51 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  56.85 
 
 
291 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  58.3 
 
 
300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  55.14 
 
 
290 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  54.45 
 
 
294 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  59.32 
 
 
275 aa  315  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  57.52 
 
 
275 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  58.02 
 
 
268 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  53.92 
 
 
291 aa  311  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  56.78 
 
 
290 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  52.58 
 
 
290 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  53.56 
 
 
293 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  56.51 
 
 
269 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  54.8 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  55.97 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  56.13 
 
 
269 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  55.97 
 
 
271 aa  308  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  55.6 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  56.13 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  55.6 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  55.97 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  52.23 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  57.4 
 
 
297 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  57.4 
 
 
297 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  56.51 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  56.51 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  56.51 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  56.51 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  54.09 
 
 
290 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  52.58 
 
 
292 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  54.85 
 
 
270 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  51.88 
 
 
339 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  56.49 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  51.88 
 
 
339 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  54.09 
 
 
290 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  54.09 
 
 
290 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  51.71 
 
 
291 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  51.71 
 
 
291 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  52.58 
 
 
292 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  51.71 
 
 
291 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  51.37 
 
 
291 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  51.03 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  51.37 
 
 
291 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  48.33 
 
 
277 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  49.66 
 
 
291 aa  291  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  48.29 
 
 
291 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  50.85 
 
 
307 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  48.29 
 
 
291 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  48.29 
 
 
291 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  54.47 
 
 
256 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  55.26 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  48.63 
 
 
291 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  51.28 
 
 
291 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  50.91 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  35.54 
 
 
246 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 
248 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  38.93 
 
 
239 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  37.15 
 
 
261 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.65 
 
 
251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  34.82 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 
244 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.14 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 
247 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  31.95 
 
 
245 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
248 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  34.57 
 
 
247 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  40.99 
 
 
238 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  35.32 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  35.48 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.24 
 
 
223 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  34.13 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  33.05 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
295 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.27 
 
 
257 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  32.84 
 
 
295 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  34.2 
 
 
295 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
295 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  32.79 
 
 
250 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 
254 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>