173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1946 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 661 aa  1353    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  37.3 
 
 		 620 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  32.96 
 
 		 698 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  33.84 
 
 		 625 aa  279  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  34.05 
 
 		 631 aa  273  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  30.79 
 
 		 625 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  33.09 
 
 		 708 aa  263  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  32.78 
 
 		 647 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  31.38 
 
 		 676 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  29.96 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  31.33 
 
 		 706 aa  233  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  29.01 
 
 		 840 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  30.44 
 
 		 798 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  29.88 
 
 		 798 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  28.46 
 
 		 779 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  31.6 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  30.04 
 
 		 799 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  29.21 
 
 		 687 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.99 
 
 		 1094 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  28.55 
 
 		 734 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  29.02 
 
 		 647 aa  204  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  29.69 
 
 		 872 aa  203  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  30.23 
 
 		 779 aa  203  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.61 
 
 		 536 aa  173  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  26.71 
 
 		 643 aa  165  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  25.09 
 
 		 1363 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  25.53 
 
 		 1380 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  25.06 
 
 		 1363 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  32.26 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.71 
 
 		 508 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.52 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  30.2 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  26.25 
 
 		 679 aa  124  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  25.92 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  25.82 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  29.46 
 
 		 1272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  24.27 
 
 		 519 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  24.45 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  28.85 
 
 		 628 aa  100  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  32.28 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  32.28 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.43 
 
 		 1201 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.84 
 
 		 512 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  27.21 
 
 		 527 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  28.02 
 
 		 1430 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  24.61 
 
 		 760 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.22 
 
 		 569 aa  91.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  32.89 
 
 		 1299 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  27.04 
 
 		 542 aa  90.9  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.11 
 
 		 516 aa  90.9  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  27.06 
 
 		 1247 aa  90.1  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  24.29 
 
 		 645 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  24.12 
 
 		 895 aa  89.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  27.11 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.11 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.74 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  23.53 
 
 		 535 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  23.53 
 
 		 535 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.74 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  27.11 
 
 		 516 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  27.11 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.11 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  29.8 
 
 		 570 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.74 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.74 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  27.11 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  27.11 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  27.11 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  30.97 
 
 		 1299 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  29.45 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  27.11 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.74 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  23.53 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  28.08 
 
 		 1973 aa  84.7  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.89 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  30 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  25.13 
 
 		 524 aa  83.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  26.88 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  29.49 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  29.96 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  30.45 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  30.45 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  31.25 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  30.45 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  30.45 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  30.45 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  30.45 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  30.45 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  30.45 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  31.58 
 
 		 1303 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  23.22 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  23.22 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.07 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  33.51 
 
 		 1601 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  23.36 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  30.91 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  30.91 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  30.91 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  30.91 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  30.91 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>