More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1796 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  62.23 
 
 		 663 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  60.59 
 
 		 648 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  100 
 
 		 679 aa  1334    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  61.14 
 
 		 646 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  58.23 
 
 		 643 aa  683    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  86.02 
 
 		 682 aa  1035    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  62.04 
 
 		 643 aa  739    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  60.94 
 
 		 646 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  93.17 
 
 		 678 aa  1140    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  61.79 
 
 		 647 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  43.57 
 
 		 652 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  43.08 
 
 		 652 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  43.63 
 
 		 652 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  39.55 
 
 		 629 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  40.37 
 
 		 634 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  39.48 
 
 		 593 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  39.72 
 
 		 593 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  38.43 
 
 		 606 aa  360  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.99 
 
 		 599 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  36.42 
 
 		 593 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  37.24 
 
 		 823 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  34.47 
 
 		 593 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  36.78 
 
 		 608 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  35.78 
 
 		 594 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  37.08 
 
 		 823 aa  321  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  35.16 
 
 		 594 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.17 
 
 		 832 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  35.47 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  35.19 
 
 		 594 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.5 
 
 		 594 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.5 
 
 		 594 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.5 
 
 		 594 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.5 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.5 
 
 		 594 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  35 
 
 		 594 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.35 
 
 		 594 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.35 
 
 		 594 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  35.19 
 
 		 594 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  34.87 
 
 		 594 aa  316  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  34.98 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.55 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.35 
 
 		 594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  36.33 
 
 		 611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  35.21 
 
 		 616 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.75 
 
 		 827 aa  308  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 589 aa  307  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 		 608 aa  306  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.91 
 
 		 830 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  35.34 
 
 		 822 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34 
 
 		 951 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  33.18 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  33.91 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  32.81 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  33.8 
 
 		 614 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  33.73 
 
 		 660 aa  300  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  33.23 
 
 		 588 aa  299  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.82 
 
 		 950 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  32.85 
 
 		 598 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  33.69 
 
 		 617 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  35.38 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  32.92 
 
 		 590 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  34.38 
 
 		 604 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  33.75 
 
 		 608 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  33.75 
 
 		 608 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  33.02 
 
 		 589 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  33.44 
 
 		 590 aa  283  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  34.07 
 
 		 597 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.73 
 
 		 603 aa  281  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.05 
 
 		 589 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  56.27 
 
 		 276 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  34.11 
 
 		 608 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  36.28 
 
 		 828 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.88 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  30.78 
 
 		 616 aa  273  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  33.54 
 
 		 589 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  54 
 
 		 258 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  52.34 
 
 		 271 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  31.92 
 
 		 597 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  31.88 
 
 		 603 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  53.94 
 
 		 258 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  53.94 
 
 		 258 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  53.54 
 
 		 258 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  53.54 
 
 		 258 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  53.54 
 
 		 258 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  52.57 
 
 		 271 aa  260  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  54.58 
 
 		 261 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.58 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.72 
 
 		 333 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  53.94 
 
 		 258 aa  258  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  33.87 
 
 		 590 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.11 
 
 		 609 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  50.78 
 
 		 255 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  34.46 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  34.13 
 
 		 590 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.97 
 
 		 258 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  52.34 
 
 		 256 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.29 
 
 		 852 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  32.32 
 
 		 954 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>