46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1785 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1785  cytochrome c prime  100 
 
 
151 aa  306  6e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.849922  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  47.55 
 
 
144 aa  127  7e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  48.25 
 
 
146 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  38.98 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  39.67 
 
 
157 aa  82  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  33.77 
 
 
149 aa  78.6  3e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0972  cytochrome c prime  40.83 
 
 
146 aa  78.2  3e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  38.33 
 
 
146 aa  74.3  6e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  33.11 
 
 
149 aa  72.4  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  30.67 
 
 
149 aa  70.1  9e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5606  cytochrome c, class II  34.71 
 
 
149 aa  68.9  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.325565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0850  cytochrome c prime  43.16 
 
 
146 aa  66.6  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.990375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1440  cytochrome c, class II  31.17 
 
 
150 aa  65.9  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  31.71 
 
 
153 aa  61.2  5e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  30.89 
 
 
153 aa  60.1  1e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1043  cytochrome c, class II  31.71 
 
 
153 aa  57.8  5e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  32.03 
 
 
172 aa  55.5  2e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  32.56 
 
 
148 aa  53.5  9e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  31.78 
 
 
159 aa  52.4  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4970  cytochrome c', putative  31.78 
 
 
155 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  31.62 
 
 
154 aa  51.6  4e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4843  cytochrome c, class II  31.01 
 
 
152 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5019  cytochrome c'  31.01 
 
 
152 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  29.61 
 
 
153 aa  48.5  3e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  29.87 
 
 
149 aa  48.9  3e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  5.71925e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  29.22 
 
 
149 aa  48.1  4e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.08946e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  29.22 
 
 
149 aa  48.1  4e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.89857e-09  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  31.61 
 
 
153 aa  48.1  4e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  30.52 
 
 
149 aa  48.1  4e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.39572e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  26.27 
 
 
155 aa  47.8  5e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  28.57 
 
 
149 aa  47.4  7e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.45313e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  28.57 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.08815e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  26.83 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5272  cytochrome c, class II  27.33 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400589  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  24.6 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  27.92 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.23618e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  27.92 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.42907e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  27.5 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  25.15 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  28 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  28 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  23.72 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  33.03 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  28.32 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2256  cytochrome c, class II  28.93 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.335708  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06854  hypothetical protein  24.14 
 
 
147 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>