167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1779 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 81 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  88.89 
 
 		 80 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  69.12 
 
 		 73 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  67.65 
 
 		 73 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  69.12 
 
 		 73 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  60.87 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  42.42 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  49.15 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  49.15 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  45.07 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  48.28 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  41.67 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  43.1 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  37.7 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  42.31 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  39.66 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  42.37 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  42.86 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  56.41 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  40 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  38.6 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  31.94 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  42.31 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  38.71 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  38.71 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.71 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 824 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4881  heavy metal transport/detoxification protein  29.82 
 
 		 64 aa  44.3  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  37.29 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>