More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1701 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  52.73 
 
 		 2852 aa  643    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 		 980 aa  1901    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.28 
 
 		 3977 aa  622  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.58 
 
 		 2667 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  41.84 
 
 		 2775 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  42.62 
 
 		 657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  43.91 
 
 		 808 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  40.6 
 
 		 1355 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  38.83 
 
 		 2796 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.18 
 
 		 668 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  39.68 
 
 		 748 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  68.49 
 
 		 2668 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  37.9 
 
 		 726 aa  351  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  67.23 
 
 		 460 aa  346  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  66.22 
 
 		 460 aa  319  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  58.59 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  56.25 
 
 		 341 aa  296  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  52.16 
 
 		 526 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.14 
 
 		 1795 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  54.4 
 
 		 2105 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  54.46 
 
 		 341 aa  279  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  51.76 
 
 		 363 aa  252  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  58.65 
 
 		 686 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.58 
 
 		 1016 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  32.96 
 
 		 613 aa  207  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  50.35 
 
 		 946 aa  204  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.86 
 
 		 1236 aa  198  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.07 
 
 		 1279 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  31.91 
 
 		 619 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  31.91 
 
 		 619 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  45.07 
 
 		 1534 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.67 
 
 		 3427 aa  181  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.22 
 
 		 9867 aa  181  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  41.46 
 
 		 1712 aa  178  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  48.19 
 
 		 2954 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  48.51 
 
 		 491 aa  177  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.94 
 
 		 1164 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.86 
 
 		 1532 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.88 
 
 		 1287 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 393 aa  175  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.3 
 
 		 1363 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40 
 
 		 1424 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.74 
 
 		 613 aa  172  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.46 
 
 		 2689 aa  171  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  44.86 
 
 		 595 aa  170  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.81 
 
 		 1855 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  30.36 
 
 		 520 aa  167  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 		 3954 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 		 2885 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.43 
 
 		 533 aa  164  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.89 
 
 		 2145 aa  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 387 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.62 
 
 		 3619 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 607 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  46.48 
 
 		 1895 aa  158  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.19 
 
 		 3619 aa  158  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  45.56 
 
 		 4334 aa  157  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40 
 
 		 833 aa  157  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  43.37 
 
 		 1400 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.18 
 
 		 1499 aa  154  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.86 
 
 		 605 aa  151  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.33 
 
 		 555 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.17 
 
 		 387 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  45.24 
 
 		 589 aa  150  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  45.93 
 
 		 219 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.71 
 
 		 3608 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.01 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.99 
 
 		 657 aa  148  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 		 1079 aa  147  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.49 
 
 		 659 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.79 
 
 		 437 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.18 
 
 		 627 aa  147  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.1 
 
 		 965 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.09 
 
 		 712 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2776  5'-Nucleotidase domain protein  31.21 
 
 		 603 aa  146  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.18 
 
 		 529 aa  145  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.23 
 
 		 1156 aa  144  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  34.89 
 
 		 437 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.99 
 
 		 260 aa  144  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  39.39 
 
 		 4687 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  46.38 
 
 		 5171 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.87 
 
 		 202 aa  141  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  27.45 
 
 		 526 aa  141  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.87 
 
 		 202 aa  141  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30 
 
 		 587 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  35.31 
 
 		 396 aa  140  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 		 982 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.81 
 
 		 2678 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.08 
 
 		 588 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  38.13 
 
 		 424 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  43.97 
 
 		 736 aa  139  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  31.18 
 
 		 860 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  37.92 
 
 		 850 aa  137  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 		 795 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  41.22 
 
 		 950 aa  134  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  46.96 
 
 		 361 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 		 245 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.91 
 
 		 532 aa  134  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  46.96 
 
 		 361 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.51 
 
 		 518 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>