More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1696 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  100 
 
 		 2105 aa  4168    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.51 
 
 		 2668 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  75.98 
 
 		 1795 aa  516  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.4 
 
 		 980 aa  284  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  52.87 
 
 		 341 aa  267  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  50.41 
 
 		 341 aa  257  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  42.6 
 
 		 526 aa  253  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  54.3 
 
 		 946 aa  252  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  53.79 
 
 		 615 aa  247  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  42.96 
 
 		 2667 aa  240  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  52.17 
 
 		 460 aa  239  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  51.35 
 
 		 2954 aa  234  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.42 
 
 		 2775 aa  229  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.23 
 
 		 1534 aa  225  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.05 
 
 		 1279 aa  225  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  44.67 
 
 		 363 aa  223  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.09 
 
 		 9867 aa  221  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  39.87 
 
 		 3954 aa  218  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  52.48 
 
 		 1164 aa  217  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.94 
 
 		 3427 aa  215  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  57.47 
 
 		 686 aa  214  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.11 
 
 		 1363 aa  213  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  48.66 
 
 		 460 aa  210  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  43.63 
 
 		 595 aa  211  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  41.31 
 
 		 1532 aa  209  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.44 
 
 		 1712 aa  206  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  43.84 
 
 		 1400 aa  204  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.83 
 
 		 3619 aa  203  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  46.37 
 
 		 1424 aa  202  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.41 
 
 		 613 aa  202  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  43.56 
 
 		 2689 aa  202  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  47.85 
 
 		 833 aa  200  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.65 
 
 		 1236 aa  199  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  38.65 
 
 		 3608 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.31 
 
 		 3619 aa  199  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  35.84 
 
 		 357 aa  196  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.89 
 
 		 1895 aa  186  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  43.09 
 
 		 4800 aa  185  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.77 
 
 		 4334 aa  184  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.17 
 
 		 2678 aa  184  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  40.94 
 
 		 1499 aa  179  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.61 
 
 		 1287 aa  178  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.27 
 
 		 1016 aa  178  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  39.17 
 
 		 965 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.71 
 
 		 1079 aa  176  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  42.77 
 
 		 2885 aa  173  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  49.13 
 
 		 4687 aa  173  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  41.71 
 
 		 393 aa  170  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  37.5 
 
 		 1156 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  38.57 
 
 		 795 aa  166  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.23 
 
 		 491 aa  164  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.01 
 
 		 2145 aa  165  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  42.12 
 
 		 1544 aa  164  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.07 
 
 		 2911 aa  163  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.15 
 
 		 387 aa  162  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  40.35 
 
 		 437 aa  160  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  46.03 
 
 		 260 aa  161  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  39.09 
 
 		 1383 aa  159  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.18 
 
 		 3209 aa  159  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  49.5 
 
 		 982 aa  158  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  40.35 
 
 		 437 aa  157  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.98 
 
 		 556 aa  157  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  41.72 
 
 		 757 aa  157  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  43.29 
 
 		 589 aa  157  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.61 
 
 		 588 aa  155  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 1043 aa  155  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  47.24 
 
 		 850 aa  151  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 387 aa  151  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 		 824 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  36.5 
 
 		 907 aa  151  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  40.25 
 
 		 396 aa  149  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.85 
 
 		 1197 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  39.78 
 
 		 820 aa  143  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  38.48 
 
 		 14829 aa  141  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  42.18 
 
 		 1884 aa  141  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.82 
 
 		 1855 aa  141  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  43.57 
 
 		 561 aa  140  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.8 
 
 		 769 aa  140  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  36.32 
 
 		 860 aa  141  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  31.18 
 
 		 890 aa  139  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  45.5 
 
 		 202 aa  139  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  45.5 
 
 		 202 aa  139  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  47.29 
 
 		 5171 aa  138  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  32.38 
 
 		 489 aa  138  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  34.82 
 
 		 959 aa  134  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  41.88 
 
 		 1883 aa  133  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  45.02 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.67 
 
 		 950 aa  131  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  41.14 
 
 		 518 aa  131  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  42.48 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  48.06 
 
 		 734 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.69 
 
 		 1145 aa  130  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48.54 
 
 		 813 aa  130  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  36.39 
 
 		 15831 aa  129  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.07 
 
 		 1884 aa  128  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  37.57 
 
 		 745 aa  128  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  47.57 
 
 		 741 aa  128  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  35.27 
 
 		 606 aa  127  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  44.95 
 
 		 639 aa  127  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.06 
 
 		 421 aa  125  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>