More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1639 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  91.84 
 
 		 331 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  77.08 
 
 		 337 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  75 
 
 		 337 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  75 
 
 		 337 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  75.3 
 
 		 337 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  64.13 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  62.05 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  62.65 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  60.74 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  61.21 
 
 		 333 aa  381  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  59.7 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  59.09 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  59.39 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  59.09 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  56.23 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  56.23 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  56.97 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  55.83 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  53.94 
 
 		 331 aa  351  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  56.19 
 
 		 407 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  55.52 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  51.24 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  51.84 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  49.24 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  52.27 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  50.46 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  50.46 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  51.66 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  48.16 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  50.76 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  49.08 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  50.91 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  44.27 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  44.58 
 
 		 335 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.53 
 
 		 338 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  41.85 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  47.01 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  53.97 
 
 		 330 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  47.72 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  49.85 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.42 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  40.18 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  37.92 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  40 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  44.58 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  40 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  45.29 
 
 		 335 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.81 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  45.59 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  43.83 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  36.22 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  35.22 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  34.35 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.04 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  37.96 
 
 		 360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.97 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  34.38 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.1 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  30.34 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.81 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.47 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  34.33 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.68 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  35.19 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  35.4 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  33.46 
 
 		 309 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  35.22 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  29.78 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 309 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  30.34 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  32.31 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  32.25 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  26.86 
 
 		 645 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  29.78 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.96 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  29.78 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  31.5 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  29.78 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  29.78 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.4 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  29.78 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  31.38 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.3 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  30.72 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.29 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  29.39 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.17 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>