More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1563 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3656  AcrB protein  44.59 
 
 
1037 aa  808  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.54 
 
 
1064 aa  797  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3092  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.98 
 
 
1056 aa  1211  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185291  normal  0.0905875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  75.97 
 
 
1063 aa  1524  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.5 
 
 
1062 aa  839  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5229  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.34 
 
 
1066 aa  778  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.536808  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2528  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.07 
 
 
1066 aa  763  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.149577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.84 
 
 
1058 aa  782  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4919  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.79 
 
 
1061 aa  779  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462641  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5072  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.38 
 
 
1062 aa  841  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193812  normal  0.0596255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  100 
 
 
1061 aa  2106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0482838  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2637  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.26 
 
 
1066 aa  769  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.91 
 
 
1040 aa  948  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.33 
 
 
1062 aa  780  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2437  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.86 
 
 
1065 aa  823  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.83 
 
 
1050 aa  761  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.1 
 
 
1037 aa  798  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43 
 
 
1089 aa  821  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3491  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.06 
 
 
1052 aa  759  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.44 
 
 
1061 aa  754  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730926  normal  0.35721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2674  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.25 
 
 
1037 aa  796  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0525  acriflavine resistance protein B  43.49 
 
 
1049 aa  779  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452979  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0390  hypothetical protein  41.61 
 
 
1055 aa  770  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.97308e-08 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3467  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.38 
 
 
1040 aa  758  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.379499  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1399  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.85 
 
 
1055 aa  773  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00114728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3305  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.36 
 
 
1046 aa  775  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0100  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  60.1 
 
 
1049 aa  1206  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1392  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.43 
 
 
1049 aa  824  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5127  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  63.19 
 
 
1043 aa  1269  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5023  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.48 
 
 
1074 aa  805  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.3 
 
 
1050 aa  778  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3257  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.59 
 
 
1073 aa  799  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662335  normal  0.89676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.08 
 
 
1055 aa  841  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  43.49 
 
 
1049 aa  781  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2030  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.77 
 
 
1035 aa  790  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0107983  hitchhiker  0.000143133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43 
 
 
1089 aa  821  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  43.49 
 
 
1049 aa  781  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.49 
 
 
1049 aa  781  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  42 
 
 
1037 aa  798  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.42 
 
 
1043 aa  939  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1126  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.12 
 
 
1048 aa  754  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.46715e-06  unclonable  4.81916e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2284  acriflavin resistance protein  41.04 
 
 
1055 aa  768  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.55 
 
 
1038 aa  911  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0153  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.82 
 
 
1050 aa  753  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1639  multidrug resistance protein MdtF  39.52 
 
 
1041 aa  771  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0267869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  43.75 
 
 
1034 aa  787  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.8 
 
 
1037 aa  794  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  43.49 
 
 
1049 aa  781  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  44 
 
 
1034 aa  788  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  42 
 
 
1037 aa  797  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  43.49 
 
 
1049 aa  781  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4353  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  76.23 
 
 
1053 aa  1619  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43 
 
 
1059 aa  778  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0514  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.81 
 
 
1069 aa  778  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0531  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.63 
 
 
1044 aa  762  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2193  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.67 
 
 
1044 aa  796  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.09 
 
 
1051 aa  765  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5136  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.87 
 
 
1102 aa  755  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.891075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.9 
 
 
1034 aa  786  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.5 
 
 
1050 aa  781  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.33 
 
 
1043 aa  795  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0739  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.57 
 
 
966 aa  796  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.828108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.29 
 
 
1049 aa  754  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.04 
 
 
1047 aa  776  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1087  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.58 
 
 
1059 aa  755  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.11 
 
 
1050 aa  765  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2481  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.87 
 
 
1042 aa  753  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107947  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4508  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.45 
 
 
1069 aa  803  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  89.09 
 
 
1063 aa  1835  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  43.5 
 
 
1050 aa  780  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  42.33 
 
 
1085 aa  793  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3374  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.62 
 
 
1061 aa  780  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0689  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.83 
 
 
1066 aa  775  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181022  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.86 
 
 
1046 aa  763  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0564  AcrB protein  39.09 
 
 
1054 aa  778  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  46.02 
 
 
1065 aa  877  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3048  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.44 
 
 
1047 aa  776  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0601242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03075  hypothetical protein  43.9 
 
 
1034 aa  786  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02323  hypothetical protein  42 
 
 
1037 aa  798  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00418  hypothetical protein  43.49 
 
 
1049 aa  781  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2511  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.14 
 
 
1052 aa  756  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1010  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.74 
 
 
1047 aa  776  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.2 
 
 
1050 aa  775  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3809  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.99 
 
 
1056 aa  788  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0639553  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3366  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.2 
 
 
1062 aa  781  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0201859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3352  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.31 
 
 
1066 aa  755  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176726  hitchhiker  0.00729316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.28 
 
 
1050 aa  763  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4832  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.69 
 
 
1054 aa  752  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2563  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.23 
 
 
1091 aa  759  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  45.09 
 
 
1069 aa  860  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01890  Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.21 
 
 
1046 aa  752  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1560  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  41.12 
 
 
1040 aa  792  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1069  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.7 
 
 
1042 aa  772  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3923  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.74 
 
 
1038 aa  765  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.72261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4641  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.42 
 
 
1052 aa  783  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463789  normal  0.947312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2295  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.04 
 
 
1122 aa  771  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2294  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.29 
 
 
1102 aa  786  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6591  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.12 
 
 
1072 aa  786  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.490488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2360  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.24 
 
 
1080 aa  764  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.216715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0821  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.04 
 
 
1062 aa  769  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265502  normal  0.847415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>