More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1554 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
239 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  49.56 
 
 
259 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  47.01 
 
 
242 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  51.12 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  51.13 
 
 
233 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  48.5 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  47.44 
 
 
217 aa  205  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  50.23 
 
 
315 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  46.4 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  46.02 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  46.05 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  48.44 
 
 
245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  45.95 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  48.17 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  43.11 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.89 
 
 
242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  43.36 
 
 
244 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  44.69 
 
 
654 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  48.68 
 
 
243 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.74 
 
 
648 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  46.55 
 
 
238 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.44 
 
 
237 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.74 
 
 
648 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.74 
 
 
648 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.44 
 
 
237 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  45.41 
 
 
232 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 
228 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 
231 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
252 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.99 
 
 
232 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
235 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  46.95 
 
 
240 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  46.61 
 
 
240 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  44.25 
 
 
230 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  44 
 
 
653 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  46.7 
 
 
246 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 
230 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  43.36 
 
 
231 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  41.82 
 
 
250 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  41.8 
 
 
648 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
286 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  45.25 
 
 
228 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  43.83 
 
 
661 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.29 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.29 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.12 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  43.04 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  43.05 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
319 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 
646 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.56 
 
 
239 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  44.8 
 
 
232 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  42.6 
 
 
232 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
228 aa  188  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.04 
 
 
232 aa  187  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  43.83 
 
 
233 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  44.84 
 
 
228 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0490  ABC transporter related  43.5 
 
 
241 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.6 
 
 
241 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  42.04 
 
 
235 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  41.3 
 
 
647 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
648 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  43.61 
 
 
231 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.42 
 
 
648 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  42.79 
 
 
648 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  42.79 
 
 
648 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  42.79 
 
 
247 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.54 
 
 
225 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4546  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
238 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0534927  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.5 
 
 
648 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
240 aa  185  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
233 aa  185  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
232 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.09 
 
 
642 aa  184  9e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  46.22 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  40.99 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  44.49 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  40.81 
 
 
237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  42.48 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  42.73 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  41.81 
 
 
232 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  46.49 
 
 
248 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  41.52 
 
 
227 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  42.6 
 
 
236 aa  182  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  43.24 
 
 
668 aa  182  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
408 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  41.1 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>