141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1553 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  50.4 
 
 
377 aa  355  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  39.41 
 
 
376 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  39.68 
 
 
376 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.74 
 
 
375 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  37.8 
 
 
410 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  33.6 
 
 
402 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 
407 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
392 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  31.39 
 
 
415 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
414 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  27.6 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  26.77 
 
 
380 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  28.34 
 
 
374 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
378 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 
378 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 
378 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 
378 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 
378 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 
378 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  27.3 
 
 
388 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  29.49 
 
 
384 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  27.98 
 
 
385 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 
378 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  26.91 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  26.82 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  25.33 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  25.66 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  26.91 
 
 
378 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  24.15 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 
380 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  27.86 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  23.88 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.27 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  27.82 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  26.18 
 
 
384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  28.08 
 
 
398 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  26.53 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
372 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  28.53 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  24.93 
 
 
366 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  23.83 
 
 
384 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  25.39 
 
 
388 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 
378 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 
378 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  25.45 
 
 
395 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  24.73 
 
 
388 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  24.32 
 
 
392 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  24.04 
 
 
378 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 
378 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 
380 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  26.99 
 
 
381 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  23.91 
 
 
397 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  24.27 
 
 
390 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  23.16 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  25.13 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  23.86 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  24.87 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  24.01 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  23.16 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  27.18 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  20.85 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  23.8 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  23.36 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  24 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  25.38 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  28.32 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.08 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  27.53 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  22.05 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  24.11 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  23.39 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  23.7 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  21.97 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  35.34 
 
 
443 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 
834 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  23.35 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  22.41 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  22.86 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  23.21 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  23.21 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  23.21 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.98 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  22.97 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.62 
 
 
452 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  21.16 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  22.62 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  30 
 
 
401 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  22.65 
 
 
401 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  23.22 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  23.33 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  23.93 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  24.13 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>