64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1513 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 556 aa  1134    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  55.52 
 
 		 635 aa  330  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  57.04 
 
 		 709 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  40.19 
 
 		 349 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  40.26 
 
 		 349 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  42.25 
 
 		 376 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  41.64 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  39.86 
 
 		 333 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  46.67 
 
 		 685 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  37.71 
 
 		 347 aa  204  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  38.14 
 
 		 336 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  39.77 
 
 		 356 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  39.39 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  44.49 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  36.17 
 
 		 363 aa  173  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 		 340 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  31.15 
 
 		 334 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  31.89 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  54.55 
 
 		 549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  32.95 
 
 		 749 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 814 aa  82  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 831 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  29.26 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  33.94 
 
 		 787 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  33.94 
 
 		 787 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  25.31 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.31 
 
 		 900 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  24.26 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  22.64 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  25.6 
 
 		 869 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  22.9 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  23 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  22.39 
 
 		 335 aa  53.9  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  27.83 
 
 		 561 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  22.95 
 
 		 863 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  29.07 
 
 		 1369 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  28.07 
 
 		 1414 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 		 814 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  29.07 
 
 		 1294 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  27.5 
 
 		 331 aa  51.2  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.35 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  19.54 
 
 		 343 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.13 
 
 		 853 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  30.4 
 
 		 601 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  28.95 
 
 		 572 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 		 468 aa  48.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  23.75 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  21.24 
 
 		 343 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 365 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  24.46 
 
 		 681 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  25.49 
 
 		 400 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  27.01 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  27.1 
 
 		 593 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.96 
 
 		 673 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 847 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.57 
 
 		 507 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  27.81 
 
 		 407 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  20.18 
 
 		 411 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.08 
 
 		 337 aa  43.9  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.79 
 
 		 705 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  28.68 
 
 		 717 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>