More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1489 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  69.86 
 
 		 774 aa  1127    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  100 
 
 		 774 aa  1556    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  72.47 
 
 		 771 aa  1156    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  26.06 
 
 		 674 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  30.23 
 
 		 679 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  25.84 
 
 		 738 aa  112  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  28.06 
 
 		 722 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  26.9 
 
 		 946 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  29.58 
 
 		 756 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  25.77 
 
 		 720 aa  95.5  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  25.18 
 
 		 723 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  29.33 
 
 		 719 aa  92  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  22.77 
 
 		 796 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  38.69 
 
 		 997 aa  81.6  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  24.47 
 
 		 783 aa  79.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  35.97 
 
 		 989 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  30.89 
 
 		 773 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  28.51 
 
 		 608 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 608 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  28.47 
 
 		 987 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 1225 aa  60.8  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  28.05 
 
 		 610 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.7 
 
 		 280 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  25.5 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  32.12 
 
 		 684 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  28.92 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  29.66 
 
 		 994 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  31.34 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  36.8 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.58 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  36.94 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  33.33 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 656 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 1426 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 380 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 511 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 1055 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 619 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  28 
 
 		 439 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 698 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 771 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 467 aa  56.2  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 431 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 1325 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 901 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  25.07 
 
 		 457 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 644 aa  55.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0325  histidine kinase  33.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 732 aa  55.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 841 aa  55.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  39.42 
 
 		 363 aa  55.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  39 
 
 		 455 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 395 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 438 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.1 
 
 		 524 aa  54.7  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 		 963 aa  54.7  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  31.75 
 
 		 671 aa  54.7  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.96 
 
 		 477 aa  54.3  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  36.96 
 
 		 357 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1928  histidine kinase  36.96 
 
 		 357 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.25 
 
 		 541 aa  54.3  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 783 aa  54.3  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 1121 aa  54.3  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26.11 
 
 		 473 aa  54.3  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  35.78 
 
 		 420 aa  54.3  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  29.7 
 
 		 471 aa  53.9  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 537 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  32.67 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  33.33 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 408 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  27.45 
 
 		 367 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3336  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 520 aa  53.9  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  29.1 
 
 		 651 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.11 
 
 		 310 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 409 aa  53.5  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  31.71 
 
 		 483 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 1050 aa  54.3  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 734 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  29.7 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 968 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 496 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 496 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 608 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 394 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  36.47 
 
 		 465 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  36.79 
 
 		 418 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  34.23 
 
 		 342 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 581 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 801 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  38.1 
 
 		 469 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 608 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>