298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1430 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  338  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  83.24 
 
 		 173 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  60.12 
 
 		 173 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  64.53 
 
 		 173 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  64.53 
 
 		 173 aa  216  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  58.96 
 
 		 173 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  63.37 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  62.21 
 
 		 173 aa  201  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  55.13 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  52.76 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  52.23 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  53.69 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  50 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  50.89 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  52.02 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  52.02 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  52.02 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  46.79 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  50.61 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  46.15 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  41.67 
 
 		 220 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  41.07 
 
 		 220 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.63 
 
 		 664 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  35.53 
 
 		 678 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  35.53 
 
 		 678 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  40.85 
 
 		 232 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  40.13 
 
 		 241 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  41.07 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.31 
 
 		 664 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  37.8 
 
 		 239 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 682 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  38.03 
 
 		 682 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.04 
 
 		 668 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  36.75 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  36.14 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  35.19 
 
 		 681 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  38.65 
 
 		 641 aa  97.4  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.86 
 
 		 483 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.86 
 
 		 671 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  36.94 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  36.91 
 
 		 211 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.93 
 
 		 676 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  33.77 
 
 		 255 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 255 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  33.77 
 
 		 255 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.04 
 
 		 469 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  35.85 
 
 		 695 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  33.77 
 
 		 218 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.19 
 
 		 662 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  34.51 
 
 		 256 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  34.27 
 
 		 686 aa  87.4  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  31.37 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  31.37 
 
 		 254 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  31.37 
 
 		 254 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  31.37 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  31.37 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  31.37 
 
 		 254 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  31.37 
 
 		 254 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 		 254 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.37 
 
 		 254 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 205 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.23 
 
 		 438 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 256 aa  84.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  39.42 
 
 		 677 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  33.56 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.96 
 
 		 684 aa  82  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.46 
 
 		 438 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0937  hypothetical protein  35.71 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.06 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 684 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  31.79 
 
 		 438 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 664 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.45 
 
 		 438 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.43 
 
 		 439 aa  77.8  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  41.26 
 
 		 672 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.13 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.79 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  29.53 
 
 		 437 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  36.23 
 
 		 672 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  33.08 
 
 		 438 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  28.19 
 
 		 437 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  33.96 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  37.96 
 
 		 672 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  31.97 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.79 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  31.51 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  30.61 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  39.61 
 
 		 672 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  28.15 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.51 
 
 		 702 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>