More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1403 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  85.46 
 
 		 227 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  77.58 
 
 		 244 aa  358  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  78.08 
 
 		 247 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  77.17 
 
 		 247 aa  353  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  75.68 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  70.59 
 
 		 232 aa  309  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  66.2 
 
 		 219 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  64.79 
 
 		 224 aa  286  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  62.44 
 
 		 225 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  63.85 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  63.08 
 
 		 221 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  62.44 
 
 		 221 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  63.59 
 
 		 230 aa  271  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  64.38 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  63.29 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  59.26 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  61.03 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  59.45 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  59.45 
 
 		 219 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  60.75 
 
 		 226 aa  257  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  58.06 
 
 		 219 aa  256  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  59.45 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  60.27 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  60.56 
 
 		 219 aa  254  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  59.91 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  60.94 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  60.83 
 
 		 221 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  59.62 
 
 		 220 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  59.91 
 
 		 221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  56.07 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  57.94 
 
 		 217 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  51.17 
 
 		 226 aa  236  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  54.46 
 
 		 218 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  62.44 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  53.52 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  60.19 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  54.71 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  62.89 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  55.87 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  44.04 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  56.77 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  57.75 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  45.75 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  48.42 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  48.02 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  45.69 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  49.23 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  47.75 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  46.29 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.4 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  44.1 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  40.09 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  45.49 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  43.1 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  43.36 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.92 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  42.37 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.99 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  43.64 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  47.11 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  39.48 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  45.33 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  41.05 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.33 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  41.88 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.53 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  39.06 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44.3 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  39.21 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  38.86 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  39.06 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.92 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  38.94 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  38.33 
 
 		 237 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  36.28 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.63 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  36.56 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  41.35 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  42.98 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40.95 
 
 		 241 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  45.71 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  40.6 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  42.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  42.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  42.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  42.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  44.25 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>