More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1371 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  100 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  81.4 
 
 
302 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  65.46 
 
 
309 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  64.8 
 
 
309 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  68.25 
 
 
317 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  67.64 
 
 
301 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  48.18 
 
 
305 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
309 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  45.1 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  47.3 
 
 
302 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  42.03 
 
 
312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  47 
 
 
311 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  48.29 
 
 
301 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  41.53 
 
 
345 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  46.01 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  43.89 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  45.49 
 
 
307 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  49.59 
 
 
323 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  44.7 
 
 
314 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  46.18 
 
 
333 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
317 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  39.93 
 
 
308 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  44.52 
 
 
331 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  43.4 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  40.2 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
272 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  42.05 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  39.26 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  38.62 
 
 
296 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  40 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  38.03 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  36.86 
 
 
277 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  32.47 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  30.36 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  25.84 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  33.08 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  29.46 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  32.71 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  24.37 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  31.9 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  29.51 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  28.09 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  31.61 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  28.02 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  27.55 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.51 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  28.83 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  28.21 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  26.57 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  31.84 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  27.69 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  31.11 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0539  oxidoreductase  33.54 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  31.35 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  29.6 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  30.06 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  25.12 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  27.31 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  30.29 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  25.1 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  25.12 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  28.09 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.57 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  32.39 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  24.41 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  27.72 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  27.74 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  30.08 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  30.08 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  30.08 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.08 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  30.08 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  28.84 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  30.96 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  29.37 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  30.04 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  29.78 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  23.78 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  30 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  26.34 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.08 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  27.59 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  29.49 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>