More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1365 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 353 aa  717    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 299 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  55.67 
 
 		 304 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  37.06 
 
 		 300 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 292 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 289 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 319 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 309 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 287 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  33.14 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 301 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 287 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  34.16 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 301 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 298 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 279 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.95 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.57 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 291 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 312 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 204 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.49 
 
 		 291 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  41.23 
 
 		 314 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  26.49 
 
 		 291 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.37 
 
 		 286 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  29.21 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  41.75 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>