More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1281 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  51.2 
 
 		 1303 aa  1142    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  65.24 
 
 		 1265 aa  1452    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  65.68 
 
 		 1271 aa  1424    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 		 1220 aa  951    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1292 aa  2568    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  66.29 
 
 		 1239 aa  1475    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  49.54 
 
 		 1301 aa  1101    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.93 
 
 		 1867 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  36.95 
 
 		 1147 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  30.52 
 
 		 1608 aa  334  8e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 924 aa  321  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 		 404 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 		 404 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 		 740 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 		 740 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 732 aa  190  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 828 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 673 aa  106  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 441 aa  95.1  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 953 aa  91.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 386 aa  80.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 		 1476 aa  78.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 418 aa  77.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.93 
 
 		 2401 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 391 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27.02 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 1067 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  25.54 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  19.44 
 
 		 778 aa  70.1  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  30.94 
 
 		 1121 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 733 aa  68.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 871 aa  66.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  40.19 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  19.57 
 
 		 854 aa  64.3  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 		 401 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 452 aa  64.3  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.06 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 		 445 aa  62  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 361 aa  62  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 413 aa  61.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 		 1400 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 367 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 816 aa  60.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 405 aa  60.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  43.82 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1444 aa  58.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 376 aa  57.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 359 aa  57.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 377 aa  57.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  30.32 
 
 		 398 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30 
 
 		 413 aa  58.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  29.26 
 
 		 378 aa  57.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 436 aa  58.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 413 aa  58.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 377 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.53 
 
 		 435 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 377 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 413 aa  56.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  24.84 
 
 		 384 aa  56.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 404 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  27.71 
 
 		 382 aa  56.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 421 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  39.44 
 
 		 364 aa  56.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0155  hypothetical protein  41.84 
 
 		 928 aa  56.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 392 aa  56.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 414 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 360 aa  55.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 364 aa  55.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  41.56 
 
 		 359 aa  55.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 419 aa  55.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 354 aa  55.1  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 391 aa  55.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  38.24 
 
 		 361 aa  55.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 		 827 aa  55.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1573  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 361 aa  55.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 820 aa  54.3  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  44.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 358 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 		 354 aa  55.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 370 aa  54.3  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 445 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>