184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1228 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 485 aa  979    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  31.03 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.21 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  29.28 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  32.89 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  30.59 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.13 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.15 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  29.39 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  29.71 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  34.23 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.51 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  26.59 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  28.32 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  29.01 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  25.83 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 		 468 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  29.05 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  27.91 
 
 		 454 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  27.45 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  28.19 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  27.84 
 
 		 462 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  28.05 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.02 
 
 		 474 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  27.77 
 
 		 457 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  26.7 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  29.02 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  26.44 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  28.54 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  27.4 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.03 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  27.37 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  28.17 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  27.81 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.12 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.35 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  28.83 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  26.87 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  30.21 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  24.22 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  26.01 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  26.01 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  26.16 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  27.15 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  26.2 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  28.12 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.84 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  22.8 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  27.95 
 
 		 454 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  24.53 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  24.31 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  27.33 
 
 		 503 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  27.33 
 
 		 503 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  25.75 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  26.91 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  25.16 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  29 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  24.52 
 
 		 504 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  28 
 
 		 468 aa  100  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.4 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.26 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  24.61 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  25.99 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  28.08 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  26.93 
 
 		 464 aa  97.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  26.3 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  25.35 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.36 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  26.9 
 
 		 482 aa  94.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  29.87 
 
 		 447 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  25.06 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  27.6 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  25.26 
 
 		 491 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  25.26 
 
 		 491 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  30.64 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  22.61 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  24.94 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  24.88 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  22.2 
 
 		 446 aa  90.9  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2639  hypothetical protein  25.26 
 
 		 473 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  25.93 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  26.19 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  25.93 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  25.93 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  25.93 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  24.71 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  24.83 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.49 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  26.26 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>