173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1123 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1062 aa  2045    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  36.91 
 
 		 995 aa  297  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  36.97 
 
 		 986 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.92 
 
 		 1029 aa  278  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  37 
 
 		 1550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.64 
 
 		 1119 aa  273  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.25 
 
 		 1285 aa  263  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.95 
 
 		 1227 aa  260  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  37.24 
 
 		 1508 aa  259  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.21 
 
 		 990 aa  258  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.12 
 
 		 1848 aa  256  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  34.7 
 
 		 1033 aa  251  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.08 
 
 		 972 aa  245  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  34.34 
 
 		 1004 aa  243  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.36 
 
 		 919 aa  243  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.58 
 
 		 1782 aa  241  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  35.21 
 
 		 2003 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.19 
 
 		 3506 aa  234  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  32.33 
 
 		 995 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  30.85 
 
 		 650 aa  229  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  34.95 
 
 		 2365 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  35.26 
 
 		 2396 aa  229  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  32.16 
 
 		 991 aa  229  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  34.95 
 
 		 2346 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  31.93 
 
 		 1519 aa  227  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  34 
 
 		 985 aa  224  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  33.58 
 
 		 1130 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  34.74 
 
 		 2371 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  34.74 
 
 		 2366 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  34.38 
 
 		 1333 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  34.61 
 
 		 994 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  31.36 
 
 		 983 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.06 
 
 		 1011 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  35.02 
 
 		 3954 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  33.4 
 
 		 1131 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.44 
 
 		 1055 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  33.4 
 
 		 1129 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.21 
 
 		 1131 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  33.21 
 
 		 1129 aa  212  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  33.21 
 
 		 1131 aa  212  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  33.21 
 
 		 1131 aa  212  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  33.21 
 
 		 1131 aa  212  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1881 aa  210  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.86 
 
 		 1001 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  31.44 
 
 		 1001 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  30.62 
 
 		 1038 aa  197  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  33.72 
 
 		 4238 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  31.45 
 
 		 1028 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  33.53 
 
 		 4238 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  33.72 
 
 		 3822 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  33.94 
 
 		 1152 aa  196  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  33.08 
 
 		 1056 aa  192  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.46 
 
 		 1125 aa  192  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 		 1164 aa  184  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.64 
 
 		 677 aa  182  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  30.74 
 
 		 1006 aa  181  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 		 980 aa  158  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.56 
 
 		 1177 aa  158  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  30.73 
 
 		 816 aa  144  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.57 
 
 		 1769 aa  137  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.78 
 
 		 1489 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.14 
 
 		 472 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  28.4 
 
 		 1016 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 1011 aa  125  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  28.52 
 
 		 2711 aa  118  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 		 470 aa  109  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.76 
 
 		 447 aa  105  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30 
 
 		 488 aa  105  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  30.88 
 
 		 423 aa  104  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  30.88 
 
 		 423 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  27.98 
 
 		 1180 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  30.88 
 
 		 423 aa  99.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.37 
 
 		 431 aa  99.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  25.86 
 
 		 407 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.85 
 
 		 1081 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.7 
 
 		 378 aa  95.9  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.26 
 
 		 465 aa  95.9  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30.39 
 
 		 634 aa  92  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  31 
 
 		 425 aa  91.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  29.1 
 
 		 641 aa  88.2  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.9 
 
 		 634 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  29.12 
 
 		 882 aa  85.5  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  34.64 
 
 		 1053 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  40.37 
 
 		 1172 aa  82  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  28.4 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  28.04 
 
 		 683 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.78 
 
 		 1066 aa  80.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.21 
 
 		 814 aa  77.4  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  47.12 
 
 		 987 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  30.12 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.35 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  25.63 
 
 		 652 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  28.12 
 
 		 1078 aa  73.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  44.97 
 
 		 1458 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  29.69 
 
 		 942 aa  72.4  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  28.04 
 
 		 965 aa  72  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  27.13 
 
 		 959 aa  72  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  40.51 
 
 		 1459 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.77 
 
 		 1532 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.83 
 
 		 378 aa  70.5  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>