55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1077 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 340 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  40.25 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  41.61 
 
 		 635 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  39.16 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  40.45 
 
 		 376 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  40.06 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  36.68 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  36.36 
 
 		 356 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  41.51 
 
 		 420 aa  205  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  37.85 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  39.74 
 
 		 709 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  38.64 
 
 		 349 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  37.5 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  35.07 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  34.12 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  26.59 
 
 		 749 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 461 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  27.13 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 814 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  26.16 
 
 		 421 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  24.08 
 
 		 831 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  23.31 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  20.92 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  25.78 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  26.15 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  24.91 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  23.47 
 
 		 505 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  23.98 
 
 		 505 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  31.43 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  26.8 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  21.34 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  29.7 
 
 		 1115 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  27.61 
 
 		 626 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  24.29 
 
 		 863 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  22.83 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  25.17 
 
 		 869 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 411 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  23.11 
 
 		 523 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  24.29 
 
 		 551 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  21.29 
 
 		 717 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  23.55 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  22.42 
 
 		 651 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  25.63 
 
 		 743 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  33.64 
 
 		 593 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  24.86 
 
 		 705 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  27.34 
 
 		 853 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  26.8 
 
 		 525 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  24.56 
 
 		 561 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>