More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1056 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 332 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.7 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.73 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.34 
 
 		 332 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.6 
 
 		 332 aa  424  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.95 
 
 		 332 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.35 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.23 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.42 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.49 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.42 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.42 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.17 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.97 
 
 		 334 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 		 355 aa  291  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  50.6 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  51.15 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  51.15 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  50.48 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  49.13 
 
 		 296 aa  271  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 341 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 295 aa  178  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  39.86 
 
 		 544 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 		 442 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.23 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 277 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 		 246 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 		 246 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 267 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 		 241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.53 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>