More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1046 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  57.84 
 
 
815 aa  735    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  82.83 
 
 
796 aa  1229    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  58.4 
 
 
814 aa  721    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  57.24 
 
 
830 aa  733    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
810 aa  1582    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  57.38 
 
 
830 aa  732    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  48.64 
 
 
750 aa  581  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  49.04 
 
 
626 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  47.97 
 
 
763 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  48.83 
 
 
714 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  48.42 
 
 
658 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  46.58 
 
 
728 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  48.53 
 
 
714 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  47.99 
 
 
775 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  46.25 
 
 
720 aa  482  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  43.94 
 
 
739 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  43.94 
 
 
727 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  44.01 
 
 
728 aa  479  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  45.61 
 
 
735 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  43.68 
 
 
720 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  43.94 
 
 
727 aa  479  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  45.85 
 
 
732 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  46.36 
 
 
734 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  47.44 
 
 
757 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  47.24 
 
 
741 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  46.45 
 
 
734 aa  465  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  48.51 
 
 
626 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  45.67 
 
 
833 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  43.22 
 
 
768 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  47.02 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  47.57 
 
 
712 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  44.23 
 
 
723 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  44.1 
 
 
770 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  43.62 
 
 
763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  43.62 
 
 
730 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  44.63 
 
 
776 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  44.63 
 
 
779 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  42.07 
 
 
757 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  44.07 
 
 
732 aa  442  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  43.86 
 
 
718 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  47.06 
 
 
727 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  45.61 
 
 
750 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  41.28 
 
 
759 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  43.22 
 
 
759 aa  435  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  45.93 
 
 
651 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  42.81 
 
 
760 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  42.26 
 
 
758 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  41.33 
 
 
769 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  42.83 
 
 
750 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  43.43 
 
 
699 aa  432  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 
712 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  41.13 
 
 
744 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  41.21 
 
 
707 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  42.13 
 
 
742 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  41.52 
 
 
724 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  41.17 
 
 
718 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  40.28 
 
 
724 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  43.52 
 
 
669 aa  412  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  42.58 
 
 
712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  41.72 
 
 
764 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  44.21 
 
 
656 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  39.78 
 
 
765 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  39.53 
 
 
784 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 
760 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  42.75 
 
 
743 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  41.34 
 
 
714 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  44.01 
 
 
654 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  40.46 
 
 
736 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  38.14 
 
 
648 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  40.43 
 
 
728 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  39.27 
 
 
709 aa  386  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  41.19 
 
 
733 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.18 
 
 
776 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 
831 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  37.35 
 
 
811 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.36 
 
 
755 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 
788 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  39.4 
 
 
788 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.61 
 
 
618 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  38.8 
 
 
735 aa  365  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.73 
 
 
712 aa  363  8e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.81 
 
 
626 aa  361  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  40.03 
 
 
729 aa  360  7e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  41.75 
 
 
761 aa  359  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  40.46 
 
 
776 aa  359  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.7 
 
 
643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.7 
 
 
643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  39.39 
 
 
824 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  39.22 
 
 
824 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.01 
 
 
643 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  38.39 
 
 
640 aa  345  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.56 
 
 
727 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.21 
 
 
654 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.35 
 
 
661 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 
668 aa  339  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  40.04 
 
 
709 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  37.59 
 
 
744 aa  338  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.03 
 
 
640 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  38.74 
 
 
625 aa  337  5.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  40.62 
 
 
801 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>