More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0948 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 490 aa  981    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.8 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.56 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.29 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  47.37 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  47.15 
 
 		 454 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  46.3 
 
 		 469 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  47.62 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  46.1 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  46.97 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  48.66 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  46.39 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  45.37 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  46.83 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.71 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  43.47 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  42.44 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.07 
 
 		 454 aa  360  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  46.49 
 
 		 448 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  44.11 
 
 		 444 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 453 aa  353  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 		 444 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  44.14 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 		 451 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.76 
 
 		 458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 471 aa  339  8e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  40.22 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  40.22 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  37.78 
 
 		 472 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  40.22 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.3 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  41.96 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 		 458 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  39.69 
 
 		 463 aa  323  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 		 483 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.92 
 
 		 441 aa  322  9.000000000000001e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  40.22 
 
 		 481 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  34.53 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  39.61 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.07 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.43 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.43 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  40.65 
 
 		 451 aa  319  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 461 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  40.31 
 
 		 460 aa  319  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 494 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  40.56 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  40.56 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 462 aa  317  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 469 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  35.41 
 
 		 453 aa  315  9e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  41.06 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 		 465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  43.35 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  38.73 
 
 		 487 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  39.82 
 
 		 460 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  34.74 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 		 500 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.99 
 
 		 460 aa  310  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  40.35 
 
 		 462 aa  309  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  39.7 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.94 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  39.29 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  38.79 
 
 		 468 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  39.25 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  33.41 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  39.7 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>