100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0920 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
680 aa  1370    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  68.18 
 
 
728 aa  871    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.48 
 
 
1155 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.34 
 
 
495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.31 
 
 
479 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  35.05 
 
 
486 aa  174  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  34.69 
 
 
477 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.59 
 
 
839 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  37.41 
 
 
619 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  42.33 
 
 
499 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.26 
 
 
485 aa  157  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.37 
 
 
481 aa  157  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.73 
 
 
554 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.08 
 
 
649 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.78 
 
 
859 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.79 
 
 
778 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.24 
 
 
860 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.73 
 
 
718 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.24 
 
 
708 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.78 
 
 
713 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.24 
 
 
445 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  35.09 
 
 
576 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.37 
 
 
489 aa  151  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  39.59 
 
 
449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.81 
 
 
502 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.16 
 
 
485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.52 
 
 
629 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.66 
 
 
818 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 
486 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.01 
 
 
515 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.08 
 
 
784 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33 
 
 
478 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.75 
 
 
1056 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.17 
 
 
988 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.74 
 
 
1056 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.75 
 
 
1022 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.68 
 
 
421 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.18 
 
 
472 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.04 
 
 
971 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.04 
 
 
971 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.67 
 
 
490 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  34.57 
 
 
527 aa  124  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.74 
 
 
1026 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.21 
 
 
915 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.43 
 
 
813 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  33.61 
 
 
276 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.98 
 
 
528 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.21 
 
 
862 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.68 
 
 
776 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  31.48 
 
 
500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  36.53 
 
 
472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  34.11 
 
 
798 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.82 
 
 
504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.11 
 
 
541 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.42 
 
 
499 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
828 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
291 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  31.27 
 
 
616 aa  107  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.22 
 
 
479 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.68 
 
 
292 aa  103  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  26.93 
 
 
657 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.89 
 
 
291 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 
474 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 
295 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.49 
 
 
289 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.45 
 
 
824 aa  98.6  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.56 
 
 
501 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  33.77 
 
 
518 aa  98.2  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.27 
 
 
502 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.36 
 
 
652 aa  94.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.82 
 
 
288 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  25.81 
 
 
654 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 
766 aa  92.8  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 
522 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
497 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  32.31 
 
 
287 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.69 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.64 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.42 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.55 
 
 
570 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  27.78 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 
397 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  31.39 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  28.38 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  27.09 
 
 
570 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.41 
 
 
798 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  32.86 
 
 
781 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.27 
 
 
477 aa  56.6  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.66 
 
 
324 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.53 
 
 
2050 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.08 
 
 
654 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 
652 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  36 
 
 
544 aa  49.7  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  29.68 
 
 
540 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  24.48 
 
 
925 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  32.22 
 
 
783 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  26.47 
 
 
903 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
900 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  23.99 
 
 
331 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  26.47 
 
 
670 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>