204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0883 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 481 aa  976    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  75.78 
 
 		 488 aa  744    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  92.79 
 
 		 483 aa  829    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  76.14 
 
 		 482 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  62.9 
 
 		 455 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  50.93 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  52.64 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  51.37 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  42.49 
 
 		 471 aa  334  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  41.89 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  41.96 
 
 		 451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  41.35 
 
 		 451 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  38.18 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  35.52 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  36.8 
 
 		 453 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  32.05 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  34.29 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.18 
 
 		 451 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.96 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.6 
 
 		 456 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.66 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.98 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  31.24 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  35.75 
 
 		 462 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  29.44 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  36.67 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  36.96 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  36.91 
 
 		 454 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  34.59 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  29.58 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.75 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.73 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  30.89 
 
 		 449 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  29.38 
 
 		 441 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  32.59 
 
 		 458 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  31.03 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.07 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  36.99 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  32.29 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  31.77 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  34.92 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.89 
 
 		 457 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  32.8 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.23 
 
 		 463 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.23 
 
 		 464 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.6 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.13 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.23 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.38 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.35 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  31.41 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  32.41 
 
 		 450 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  31.71 
 
 		 462 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  31.07 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  32.37 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.28 
 
 		 446 aa  156  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  30.37 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  32.04 
 
 		 442 aa  153  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.39 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.28 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  32.07 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.46 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.53 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.89 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 		 461 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.05 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.96 
 
 		 476 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.9 
 
 		 457 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  31.96 
 
 		 443 aa  146  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.72 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.29 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  28.6 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.51 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.29 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.29 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  30.19 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  33.25 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  32.65 
 
 		 472 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  25.32 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.56 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  29.07 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.77 
 
 		 481 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  29.16 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  26.81 
 
 		 481 aa  129  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.09 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 		 476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  27.1 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 		 465 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  24.5 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>