104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0794 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  100 
 
 
491 aa  936    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  70.31 
 
 
485 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  66.53 
 
 
487 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  70.04 
 
 
484 aa  616  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  69.42 
 
 
484 aa  601  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  59.7 
 
 
479 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  53.51 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  47.73 
 
 
462 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  50.82 
 
 
464 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  47.42 
 
 
521 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  49.48 
 
 
461 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  48.25 
 
 
463 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  48.86 
 
 
469 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  45.02 
 
 
469 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  45.76 
 
 
471 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  45.55 
 
 
471 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  45.25 
 
 
469 aa  385  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  44.99 
 
 
489 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  39.87 
 
 
459 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  39.87 
 
 
459 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  46.39 
 
 
483 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  48.31 
 
 
452 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  41.29 
 
 
479 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  37.63 
 
 
479 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  39.1 
 
 
478 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  39.45 
 
 
478 aa  296  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  37.24 
 
 
479 aa  296  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  37.08 
 
 
479 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  37.08 
 
 
479 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  37.21 
 
 
479 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  37.29 
 
 
479 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  37.29 
 
 
479 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  40.3 
 
 
463 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  37.24 
 
 
479 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  39.2 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  38.65 
 
 
466 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  37.04 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  36.97 
 
 
479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  39.62 
 
 
463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  39.2 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  39.67 
 
 
465 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  39.2 
 
 
463 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  41.03 
 
 
463 aa  279  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  39.49 
 
 
463 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  39.88 
 
 
463 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  39.88 
 
 
463 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  39.88 
 
 
463 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  38.72 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  38.19 
 
 
463 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  38.51 
 
 
466 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  39.66 
 
 
466 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  39.18 
 
 
463 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  39.45 
 
 
466 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  38.45 
 
 
463 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  39.61 
 
 
463 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  40.78 
 
 
466 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  39.39 
 
 
463 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  36.12 
 
 
465 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  38.14 
 
 
461 aa  257  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  38.77 
 
 
495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  38.33 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  38.75 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  38.28 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  38.53 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  38.28 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  38.77 
 
 
467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  38.77 
 
 
467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  37.58 
 
 
463 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  37.47 
 
 
463 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  38.35 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  40.17 
 
 
466 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  35.36 
 
 
431 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  35.46 
 
 
428 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  35.48 
 
 
464 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  35.15 
 
 
457 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  46.36 
 
 
141 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  46.36 
 
 
141 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  46.36 
 
 
141 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  46.36 
 
 
141 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  34.29 
 
 
499 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  33.58 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  29.48 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  29.48 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  31.73 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0693  fructuronate transporter  35.35 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  29.48 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  29.48 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  35.35 
 
 
493 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  29.48 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  29.48 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  29.48 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  27.74 
 
 
418 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  28.22 
 
 
430 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>