More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0774 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  100 
 
 
421 aa  811    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  67.07 
 
 
435 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  64.51 
 
 
430 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  63.81 
 
 
434 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  64.88 
 
 
415 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  64.88 
 
 
415 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  63.55 
 
 
474 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  63.32 
 
 
457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  63.08 
 
 
474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  63.08 
 
 
474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  63.32 
 
 
457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  63.08 
 
 
474 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  63.08 
 
 
474 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  62.8 
 
 
416 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  59.19 
 
 
428 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  59.19 
 
 
445 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  59.95 
 
 
429 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  58.92 
 
 
429 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  59.33 
 
 
445 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  61.35 
 
 
423 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  60.86 
 
 
428 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  61.39 
 
 
424 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  61.39 
 
 
424 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  61.39 
 
 
424 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  60.29 
 
 
432 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  59.23 
 
 
398 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  68.66 
 
 
411 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  59.23 
 
 
398 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  59.23 
 
 
398 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  55.1 
 
 
432 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  55.1 
 
 
432 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  55.1 
 
 
432 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  55.56 
 
 
434 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  55.8 
 
 
434 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 
433 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  54.37 
 
 
432 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  55.91 
 
 
427 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  52.94 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  53.79 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  52.58 
 
 
428 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  53.16 
 
 
428 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  51.96 
 
 
428 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  51.96 
 
 
428 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  53.06 
 
 
409 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  52.81 
 
 
409 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  53.19 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  53.43 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  51.68 
 
 
420 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  50.61 
 
 
409 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  49.16 
 
 
429 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  51.2 
 
 
420 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  51.2 
 
 
420 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  51.2 
 
 
420 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  52.32 
 
 
436 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  50.47 
 
 
420 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  50.98 
 
 
411 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  49.52 
 
 
429 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
428 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  51.72 
 
 
434 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
430 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  52.81 
 
 
437 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  51.48 
 
 
425 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  51.48 
 
 
425 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  47.49 
 
 
423 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 
419 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  49.02 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  50.49 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 
423 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  41.2 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  50.48 
 
 
436 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  43.78 
 
 
433 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  43.27 
 
 
436 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  42.11 
 
 
441 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  40.47 
 
 
428 aa  279  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.62 
 
 
415 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  37.34 
 
 
415 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  37.08 
 
 
415 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.7 
 
 
418 aa  186  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  35.52 
 
 
410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.77 
 
 
412 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
410 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  35.22 
 
 
415 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  33.17 
 
 
410 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  30.28 
 
 
432 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  34.01 
 
 
412 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  35.66 
 
 
415 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  35.66 
 
 
415 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.81 
 
 
432 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
432 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.41 
 
 
432 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
433 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
433 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.81 
 
 
433 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.58 
 
 
432 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.2 
 
 
415 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.64 
 
 
425 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  33.41 
 
 
402 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.49 
 
 
433 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  31.55 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  33.17 
 
 
408 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>