More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0763 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  64.05 
 
 		 256 aa  318  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  49.36 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  46.89 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  46.89 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  42.29 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  42.62 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  42.62 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  38.28 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  38.65 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  38.28 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  38.28 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  36.33 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  37.6 
 
 		 338 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  38.84 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  38.02 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  31.12 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  37 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.18 
 
 		 243 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  29.54 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.66 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  29.24 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  31.12 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  31.65 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.51 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  27.31 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  24.46 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  27.44 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  31.43 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  22.97 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  28.92 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  25 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  26.25 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.19 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  22.81 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  31.02 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  22.52 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  24.78 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  25.77 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  27.8 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  30.04 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.31 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  30.04 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  30.69 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  26.82 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  28.57 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  29.63 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  28.31 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  26.45 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  27.39 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  27.39 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  27.78 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  29.15 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  27.01 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  26.32 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  25.53 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>