More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0723 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  452  1e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  81.45 
 
 
230 aa  344  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.32 
 
 
226 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.75 
 
 
225 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.2 
 
 
226 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  55.2 
 
 
224 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  54.75 
 
 
226 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.67 
 
 
224 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
222 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  42.19 
 
 
243 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.73 
 
 
236 aa  140  2e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.93 
 
 
219 aa  129  4e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
230 aa  127  1e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.16 
 
 
243 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.16 
 
 
243 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.73 
 
 
225 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.79 
 
 
226 aa  121  1e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
225 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
225 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.74 
 
 
225 aa  118  8e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  36.7 
 
 
239 aa  116  2e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.76 
 
 
220 aa  117  2e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
227 aa  116  2e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 
242 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
237 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 
225 aa  114  1e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
226 aa  113  2e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.58 
 
 
225 aa  113  2e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  33.84 
 
 
226 aa  112  4e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
228 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
225 aa  110  1e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
227 aa  111  1e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.23 
 
 
224 aa  110  2e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.08 
 
 
228 aa  110  2e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.56 
 
 
231 aa  110  2e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
228 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.69 
 
 
225 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
227 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 
228 aa  109  4e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.72 
 
 
228 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.67 
 
 
225 aa  108  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
235 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
235 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
228 aa  108  7e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.33 
 
 
236 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  32.55 
 
 
225 aa  108  9e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
223 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 
243 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
227 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.7 
 
 
232 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.03 
 
 
226 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
235 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41213e-05 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 
239 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
227 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
248 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
229 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.49 
 
 
224 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.55 
 
 
226 aa  105  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.76 
 
 
226 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
241 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
239 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 
251 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.7 
 
 
243 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
239 aa  104  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.55 
 
 
226 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.03 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
230 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.52774e-08  hitchhiker  1.98015e-05 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 
266 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.33 
 
 
239 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
226 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
226 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
235 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 
225 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
230 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
228 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  8.36213e-06 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.25 
 
 
224 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
239 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
239 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
231 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  27.6 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.18 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
225 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 
228 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  9.77836e-11 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.38 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.84 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.25437e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  30.89 
 
 
221 aa  98.2  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  32.46 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  32.46 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  32.46 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>