More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0709 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  100 
 
 
124 aa  241  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  84.03 
 
 
124 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  82.11 
 
 
116 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  74.53 
 
 
115 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  74.53 
 
 
115 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  80.9 
 
 
115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  72.92 
 
 
121 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  65.14 
 
 
121 aa  136  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  59.02 
 
 
122 aa  130  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  57.38 
 
 
122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  68.48 
 
 
121 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  56.88 
 
 
119 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  69.57 
 
 
324 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  59.48 
 
 
125 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  68.13 
 
 
367 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  72.04 
 
 
110 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  63.64 
 
 
153 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  70.33 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  66.32 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60 
 
 
360 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60 
 
 
360 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  71.95 
 
 
371 aa  116  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  66.32 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  57.43 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  65.26 
 
 
124 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  62.37 
 
 
211 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
198 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61.29 
 
 
242 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61.29 
 
 
242 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  65.26 
 
 
124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  61.29 
 
 
230 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  61.29 
 
 
230 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  61.29 
 
 
211 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  61.29 
 
 
211 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  61.29 
 
 
211 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  59.62 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  64.21 
 
 
155 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
134 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  58.62 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.99 
 
 
206 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  61.7 
 
 
124 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
163 aa  110  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  63.41 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6400  rare lipoprotein A  63.83 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  60.47 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  70.89 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  58.24 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  64.37 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  63.22 
 
 
120 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  48.74 
 
 
261 aa  107  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  62.07 
 
 
179 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  59.6 
 
 
114 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  66.67 
 
 
257 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  53.54 
 
 
117 aa  105  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  54.13 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
212 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
303 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  54.78 
 
 
168 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
335 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
221 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  68.75 
 
 
169 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  65 
 
 
200 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  58.75 
 
 
202 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  64.56 
 
 
165 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  57.58 
 
 
139 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  60.71 
 
 
181 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  57.45 
 
 
122 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
171 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  58.75 
 
 
203 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  55.68 
 
 
160 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  55.68 
 
 
160 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  58.75 
 
 
203 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  58.75 
 
 
203 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.79 
 
 
170 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  58.75 
 
 
213 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
167 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
124 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  64.56 
 
 
157 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  60.24 
 
 
213 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  63.75 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  59.76 
 
 
213 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  58.75 
 
 
213 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  67.5 
 
 
168 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
150 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  62.96 
 
 
367 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  60.76 
 
 
342 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  62.82 
 
 
163 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  57.5 
 
 
214 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  69.23 
 
 
160 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  67.95 
 
 
156 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  44.88 
 
 
239 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
175 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  67.95 
 
 
159 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  48.74 
 
 
185 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
127 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.47 
 
 
262 aa  100  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>