More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0702 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 667 aa  1285    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  41.36 
 
 		 3560 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 700 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 		 3035 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  45.53 
 
 		 654 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  39.43 
 
 		 4489 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  41.7 
 
 		 1085 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 1094 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 761 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 		 647 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 618 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 660 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 909 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 750 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  33.12 
 
 		 816 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 732 aa  360  6e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  37.71 
 
 		 740 aa  354  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 611 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 739 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 		 574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 616 aa  327  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 569 aa  321  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 		 672 aa  311  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  47.54 
 
 		 492 aa  301  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 706 aa  301  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  42.76 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 		 808 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  37.6 
 
 		 560 aa  291  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  35.56 
 
 		 632 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.6 
 
 		 1106 aa  280  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1106 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  40.76 
 
 		 590 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 		 590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  38.83 
 
 		 395 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  41.43 
 
 		 452 aa  275  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  32.11 
 
 		 680 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 750 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  37.32 
 
 		 568 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  38.07 
 
 		 566 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 632 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  37.99 
 
 		 657 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  37.4 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  42.91 
 
 		 295 aa  251  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 		 570 aa  249  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 		 732 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  37.4 
 
 		 633 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  37.23 
 
 		 637 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 708 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.11 
 
 		 585 aa  247  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  32.98 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.38 
 
 		 789 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.11 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 718 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 968 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1714 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 828 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.09 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.09 
 
 		 739 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 626 aa  230  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.13 
 
 		 589 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 789 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 828 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 619 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  37.34 
 
 		 624 aa  228  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 828 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 754 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 633 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 598 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 754 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  35.8 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 699 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 713 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  31.01 
 
 		 821 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 717 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  31.01 
 
 		 776 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  31.01 
 
 		 776 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  31.01 
 
 		 776 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 776 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  30.7 
 
 		 821 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 717 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 776 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 833 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 		 667 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 833 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 824 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.17 
 
 		 797 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.76 
 
 		 739 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  30.62 
 
 		 790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.3 
 
 		 708 aa  200  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  30.83 
 
 		 596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.49 
 
 		 790 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.87 
 
 		 715 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.63 
 
 		 740 aa  194  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 693 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.04 
 
 		 742 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.8 
 
 		 937 aa  191  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 822 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  29.26 
 
 		 781 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>