More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0678 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 928 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 928 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  55.45 
 
 		 1004 aa  1046    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 928 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 934 aa  686    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  78.3 
 
 		 1047 aa  1619    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  39.47 
 
 		 918 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 913 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  50.7 
 
 		 937 aa  954    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  41.97 
 
 		 946 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  79.48 
 
 		 1060 aa  1663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.82 
 
 		 936 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  57.47 
 
 		 940 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 922 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  56.27 
 
 		 979 aa  1093    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  61.42 
 
 		 1000 aa  1212    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 947 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 922 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 923 aa  642    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  41.8 
 
 		 937 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 917 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  55.08 
 
 		 979 aa  1051    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 932 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 930 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  38.25 
 
 		 956 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  42.31 
 
 		 915 aa  693    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 928 aa  700    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  41.93 
 
 		 941 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 923 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  42.57 
 
 		 924 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  54.74 
 
 		 1010 aa  1045    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  51.83 
 
 		 937 aa  964    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 928 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  100 
 
 		 1016 aa  2047    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 935 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  50.8 
 
 		 937 aa  954    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 928 aa  700    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  41.47 
 
 		 917 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  53.94 
 
 		 1025 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  49.8 
 
 		 941 aa  894    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  42.27 
 
 		 928 aa  695    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  56.7 
 
 		 976 aa  1085    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  42.62 
 
 		 917 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  55.09 
 
 		 1020 aa  1016    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.88 
 
 		 939 aa  724    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 928 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 943 aa  663    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  56.39 
 
 		 915 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 934 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 932 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 928 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  78.51 
 
 		 1047 aa  1638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  53.68 
 
 		 973 aa  983    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 928 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  53.8 
 
 		 1032 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  49.01 
 
 		 945 aa  852    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  43.33 
 
 		 933 aa  700    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  57.7 
 
 		 929 aa  687    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  40.46 
 
 		 957 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  59.53 
 
 		 1043 aa  1189    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  53.91 
 
 		 1021 aa  1047    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  40.46 
 
 		 910 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  41.59 
 
 		 944 aa  679    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 942 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 921 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  53.85 
 
 		 1033 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.95 
 
 		 928 aa  680    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  54.41 
 
 		 1014 aa  1019    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 988 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  41.25 
 
 		 934 aa  668    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  41.27 
 
 		 936 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  51.59 
 
 		 968 aa  985    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  59.55 
 
 		 935 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  49.35 
 
 		 937 aa  861    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  41.96 
 
 		 917 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  49.55 
 
 		 932 aa  885    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  56.78 
 
 		 978 aa  1098    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 928 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.72 
 
 		 923 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  39.32 
 
 		 938 aa  650    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.96 
 
 		 951 aa  706    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  56.31 
 
 		 978 aa  1093    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 928 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 928 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  41.73 
 
 		 937 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 932 aa  696    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 915 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  60.29 
 
 		 928 aa  779    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 917 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  43 
 
 		 934 aa  704    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 930 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 931 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  40.65 
 
 		 921 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  41.96 
 
 		 917 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 941 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  41.96 
 
 		 917 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 930 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  43.71 
 
 		 911 aa  741    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40.12 
 
 		 922 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 927 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>