More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0626 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 215 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  50.23 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  50.94 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  52.76 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  50.73 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  50.73 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  53.57 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  51.96 
 
 		 355 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  50.72 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  47.51 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  45.54 
 
 		 245 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  49 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  42 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  35.68 
 
 		 199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.56 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  48.91 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.9 
 
 		 457 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.28 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.84 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4279  hypothetical protein  74.39 
 
 		 121 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  36.42 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.05 
 
 		 521 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.67 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  30.58 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  32.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  32.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  30.61 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  32.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  32.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  38.76 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.5 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  31.66 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.4 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  39.52 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  32.52 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.92 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30.92 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  31.55 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30.92 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  31.09 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.92 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  33.66 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 		 172 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  34.81 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  33.94 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  34.21 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  31.72 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.72 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  31.72 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.76 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  31.72 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  31.72 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  34.67 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  31.72 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  34.67 
 
 		 172 aa  85.1  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  33.94 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  28.36 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  32.12 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.21 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  32.12 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  32.12 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  27.27 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  34.3 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.04 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  30.41 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  39.26 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.25 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  30.85 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.12 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  36.76 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  34.16 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  31.58 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  31.58 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.82 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  37.09 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.96 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 		 671 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  27.69 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  32.11 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  30.72 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  34.42 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>