230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0601 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0601  ATPase  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  65 
 
 
271 aa  352  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  63.14 
 
 
268 aa  350  1e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  61.69 
 
 
267 aa  350  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  65.64 
 
 
268 aa  349  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  61.69 
 
 
267 aa  348  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  60.94 
 
 
267 aa  348  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  63.42 
 
 
266 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  64.17 
 
 
307 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  60.54 
 
 
267 aa  345  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  60.54 
 
 
267 aa  345  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  64.96 
 
 
272 aa  345  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  61.87 
 
 
267 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  61.87 
 
 
267 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  64.29 
 
 
278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  61.72 
 
 
267 aa  342  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  64.29 
 
 
269 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  61.72 
 
 
267 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  63.04 
 
 
266 aa  337  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  65.08 
 
 
268 aa  337  9e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  62.07 
 
 
268 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  62.08 
 
 
272 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  60.63 
 
 
270 aa  329  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  59.14 
 
 
279 aa  329  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  60.23 
 
 
285 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  61.07 
 
 
265 aa  328  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  59.23 
 
 
272 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  59.23 
 
 
272 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  58.2 
 
 
268 aa  323  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  57.03 
 
 
267 aa  322  5e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  54.44 
 
 
266 aa  311  5.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.08 
 
 
271 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  58.08 
 
 
276 aa  308  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  61.18 
 
 
280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.64 
 
 
286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  51.47 
 
 
280 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  58.98 
 
 
270 aa  301  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.69 
 
 
286 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  57.42 
 
 
284 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  61.92 
 
 
277 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  56.75 
 
 
267 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.95 
 
 
267 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  55.86 
 
 
271 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  55.39 
 
 
279 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  57.58 
 
 
270 aa  289  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  56.35 
 
 
265 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  55.47 
 
 
260 aa  285  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  55.78 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  55.78 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  55.51 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  57.65 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  55.56 
 
 
260 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  58.4 
 
 
283 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  54.9 
 
 
270 aa  280  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  58.4 
 
 
283 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  58.4 
 
 
283 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  55.56 
 
 
275 aa  279  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  57.87 
 
 
260 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  57.87 
 
 
260 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.54 
 
 
271 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  56.47 
 
 
273 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  60 
 
 
282 aa  275  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  53.39 
 
 
260 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  52.78 
 
 
285 aa  275  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  56.86 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.38 
 
 
266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  56.86 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  56.86 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  57.14 
 
 
270 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  55.65 
 
 
269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.11 
 
 
270 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  52.85 
 
 
270 aa  262  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  52.44 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  51.57 
 
 
272 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  52.42 
 
 
270 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  50.61 
 
 
266 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  50 
 
 
267 aa  234  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  47.6 
 
 
267 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  47.6 
 
 
267 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  46.8 
 
 
267 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.91 
 
 
308 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.5 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.42 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  26.17 
 
 
263 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  26.17 
 
 
263 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  31.05 
 
 
324 aa  89  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.97 
 
 
4917 aa  89  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  30.59 
 
 
313 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  32 
 
 
4844 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  30.77 
 
 
4979 aa  83.6  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.15 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.27 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.33 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  27.16 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.85 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.27 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.27 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  26.27 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.27 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.27 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>