More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0582 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  100 
 
 		 481 aa  906    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  99.79 
 
 		 466 aa  922    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  70.82 
 
 		 402 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  65.13 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  60.61 
 
 		 453 aa  548  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  61.12 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  61.12 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  61.5 
 
 		 437 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  58.53 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  58.53 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  58.53 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  61.5 
 
 		 437 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  61.5 
 
 		 437 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  61.5 
 
 		 437 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  59.44 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  62.06 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  61.84 
 
 		 465 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  62.06 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  62.06 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  62.06 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  62.06 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  62.06 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  62.35 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  69.59 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  48.32 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  45.27 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  45.27 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  45.27 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  45.27 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  45.27 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  42.64 
 
 		 519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  42.64 
 
 		 519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  48.4 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  42.64 
 
 		 519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  48.4 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  48.14 
 
 		 519 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  48.14 
 
 		 519 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  47.79 
 
 		 385 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  47.79 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  45.21 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  41.36 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  41 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  41.36 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  45.09 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  39.26 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  40.53 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  39.26 
 
 		 380 aa  280  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  40.99 
 
 		 401 aa  277  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  40.45 
 
 		 386 aa  277  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  45.89 
 
 		 386 aa  276  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  43.73 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  43.73 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  43.73 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  40.41 
 
 		 400 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  40.36 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  45.15 
 
 		 409 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  43.85 
 
 		 343 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  45.48 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  45.48 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  45.48 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  45.36 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 		 386 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  43.73 
 
 		 386 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  44.41 
 
 		 326 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  44.41 
 
 		 326 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>