112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0543 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  100 
 
 
693 aa  1291    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  98.55 
 
 
692 aa  1202    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  58.68 
 
 
1562 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  63.13 
 
 
620 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  62.32 
 
 
630 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  44.82 
 
 
523 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  48.05 
 
 
522 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  47.75 
 
 
514 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  47.45 
 
 
516 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  43.57 
 
 
523 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  48.81 
 
 
888 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  48.99 
 
 
892 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  51.13 
 
 
737 aa  217  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  48.65 
 
 
888 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  40.31 
 
 
536 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  48.3 
 
 
537 aa  206  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  47.27 
 
 
886 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  46.91 
 
 
886 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  50.57 
 
 
528 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  54.4 
 
 
397 aa  183  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  50.47 
 
 
399 aa  183  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  50.5 
 
 
399 aa  181  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  58.01 
 
 
405 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  54.07 
 
 
405 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  58.01 
 
 
405 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  42.56 
 
 
572 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  50.47 
 
 
399 aa  176  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  55.8 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52 
 
 
420 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  55.25 
 
 
405 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  49.28 
 
 
432 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  42.67 
 
 
578 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  48.08 
 
 
375 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.74 
 
 
400 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  40.22 
 
 
393 aa  154  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  46.08 
 
 
735 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  51.97 
 
 
746 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  55.91 
 
 
753 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  58.27 
 
 
762 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  48.19 
 
 
272 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  46.71 
 
 
275 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  46.39 
 
 
272 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  41.03 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  43.18 
 
 
272 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  44.63 
 
 
272 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  44.63 
 
 
272 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  44.91 
 
 
275 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  43.5 
 
 
272 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  39.04 
 
 
289 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  33.9 
 
 
547 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  35.03 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  34.55 
 
 
273 aa  77  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  33.55 
 
 
273 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  34.55 
 
 
272 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  34.04 
 
 
320 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  32.98 
 
 
320 aa  64.7  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  32.98 
 
 
320 aa  63.9  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  40 
 
 
289 aa  61.6  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  31.91 
 
 
320 aa  61.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  34.41 
 
 
395 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  32.95 
 
 
321 aa  60.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 
395 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  31.87 
 
 
395 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  32.98 
 
 
320 aa  58.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  33.33 
 
 
321 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  29.19 
 
 
279 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.07 
 
 
380 aa  54.7  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  29.79 
 
 
585 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  31.87 
 
 
302 aa  54.7  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  31.51 
 
 
292 aa  54.3  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  28.09 
 
 
282 aa  53.9  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  29.34 
 
 
475 aa  53.9  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  29.09 
 
 
275 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  30.77 
 
 
302 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  29.16 
 
 
475 aa  53.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  27.53 
 
 
282 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  33.68 
 
 
327 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  27.81 
 
 
277 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  25.75 
 
 
274 aa  51.2  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  32.26 
 
 
389 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  45.16 
 
 
587 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  30.34 
 
 
293 aa  50.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  26.35 
 
 
274 aa  50.8  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  28.57 
 
 
302 aa  50.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  29.67 
 
 
301 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  34.07 
 
 
292 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  34.72 
 
 
311 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  33.33 
 
 
389 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  26.3 
 
 
462 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  25.16 
 
 
488 aa  48.5  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1338  flagellin  24.45 
 
 
576 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  31.51 
 
 
282 aa  48.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  27.47 
 
 
592 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  29.67 
 
 
303 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  28.42 
 
 
303 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  29.79 
 
 
439 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  28.03 
 
 
522 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  25.73 
 
 
281 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  43.06 
 
 
519 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>