More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0533 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
422 aa  865    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  41.12 
 
 
1207 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
1209 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
426 aa  163  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
351 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  38.11 
 
 
443 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.46 
 
 
431 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  37.32 
 
 
417 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  38.31 
 
 
520 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  36.18 
 
 
439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  36.18 
 
 
439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  36.18 
 
 
439 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  39.91 
 
 
381 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  35.2 
 
 
435 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  34.32 
 
 
407 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 
396 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.83 
 
 
355 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  41.24 
 
 
531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  38.72 
 
 
395 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  39.02 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.34 
 
 
1075 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  36.57 
 
 
395 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  30.59 
 
 
730 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.8 
 
 
695 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  37.37 
 
 
1169 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
350 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 
351 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  37.5 
 
 
1773 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  32.98 
 
 
1987 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  34.03 
 
 
816 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  34.74 
 
 
868 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  28.57 
 
 
1128 aa  94.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  33.33 
 
 
1198 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.61 
 
 
703 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  33.51 
 
 
1196 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  34.78 
 
 
806 aa  87.4  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 
479 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  30.46 
 
 
1165 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 
702 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 
532 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  33.15 
 
 
1003 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.76 
 
 
665 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
738 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  29.81 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  28.24 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.48 
 
 
611 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  27.93 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  29.69 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 
526 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.07 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.72 
 
 
518 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
1046 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.37 
 
 
758 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 
526 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.18 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 
643 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  33.33 
 
 
518 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 
903 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  36.31 
 
 
1160 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 
524 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.41 
 
 
637 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45310  predicted protein  29.32 
 
 
780 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
1172 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_4823  predicted protein  35.07 
 
 
145 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.02 
 
 
678 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  32.21 
 
 
1093 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  26.4 
 
 
529 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  37.41 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  30.56 
 
 
546 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  36.69 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.88 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.23 
 
 
861 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 
641 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 
864 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.74 
 
 
1014 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.16 
 
 
656 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  35.62 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.9 
 
 
1089 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.79 
 
 
859 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.98 
 
 
584 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.95 
 
 
1081 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  28.4 
 
 
584 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.07 
 
 
701 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  38.62 
 
 
593 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
860 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.54 
 
 
1080 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02372  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
217 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 
746 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.67 
 
 
1055 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>