More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0492 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  87.3 
 
 		 248 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  73.73 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  72.61 
 
 		 248 aa  357  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  72.61 
 
 		 248 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  71.95 
 
 		 250 aa  344  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  66.1 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  61.97 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  60.58 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  61.28 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  60.09 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  59.4 
 
 		 257 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  58.09 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  60.91 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  56.22 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  54.81 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  57.71 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  53.09 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  53.88 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  55.56 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  51.27 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  51.28 
 
 		 243 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  50.62 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  50.44 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  51.07 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  49.37 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  52.17 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  49.78 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  47.68 
 
 		 243 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  48.52 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  48.31 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  47.3 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  45.78 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  45.13 
 
 		 221 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  44.25 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  40.44 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  41.15 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.74 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 226 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  35.74 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  37.83 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  40.43 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  39.06 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  39.06 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  38.46 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  40.68 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  36.25 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  40.53 
 
 		 222 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  40 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  34.6 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  40.43 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  35.22 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  35.83 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  34.05 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  34.73 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  37.02 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  34.73 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  34.31 
 
 		 225 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  34.63 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  35.62 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  34.02 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  34.31 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  34.8 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  35.83 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  38.86 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  35.63 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  31.28 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  34.73 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  32.33 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  34.21 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  31.49 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  33.74 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  32.92 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  32.1 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  36.28 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  34.73 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  31.8 
 
 		 319 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  29.96 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  31.56 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>