81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0491 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  63.31 
 
 		 1047 aa  1185    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  63.71 
 
 		 1054 aa  1169    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  63.43 
 
 		 1045 aa  1190    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  44.3 
 
 		 1043 aa  678    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1040 aa  1974    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  63.59 
 
 		 1047 aa  1189    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  84.74 
 
 		 1037 aa  1597    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  41.49 
 
 		 1049 aa  625  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  42 
 
 		 1049 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  42.39 
 
 		 1053 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  40.42 
 
 		 1076 aa  609  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  42.55 
 
 		 1048 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  41.59 
 
 		 1049 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  42.12 
 
 		 1042 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.69 
 
 		 1048 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  45.44 
 
 		 1015 aa  589  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  39.28 
 
 		 1052 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.95 
 
 		 1042 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  39.85 
 
 		 1052 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  39.85 
 
 		 1052 aa  555  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  39.15 
 
 		 1001 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  36.89 
 
 		 1047 aa  540  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  37.48 
 
 		 1064 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  38.5 
 
 		 1064 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  37.58 
 
 		 1062 aa  515  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  37 
 
 		 1059 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  40.47 
 
 		 1018 aa  499  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1016 aa  389  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  36.93 
 
 		 1014 aa  389  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  35.51 
 
 		 991 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  33.9 
 
 		 977 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  33.94 
 
 		 993 aa  345  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  33.37 
 
 		 988 aa  339  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.51 
 
 		 986 aa  322  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  34.21 
 
 		 991 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  35.59 
 
 		 959 aa  301  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  33.85 
 
 		 980 aa  298  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  39.44 
 
 		 999 aa  232  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  39.74 
 
 		 1000 aa  225  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  38.02 
 
 		 997 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  37.8 
 
 		 997 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.79 
 
 		 911 aa  184  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.19 
 
 		 914 aa  172  4e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.66 
 
 		 890 aa  145  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.91 
 
 		 958 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.88 
 
 		 962 aa  103  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  28.77 
 
 		 976 aa  88.6  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.25 
 
 		 957 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28.44 
 
 		 947 aa  86.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.41 
 
 		 788 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.12 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  25.68 
 
 		 779 aa  81.3  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.12 
 
 		 788 aa  79.7  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  28.06 
 
 		 951 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.83 
 
 		 836 aa  73.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  24.23 
 
 		 994 aa  67.4  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  22.82 
 
 		 911 aa  64.7  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  41.3 
 
 		 142 aa  62  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  28.76 
 
 		 846 aa  60.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  25.2 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  20.99 
 
 		 794 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.86 
 
 		 951 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.51 
 
 		 1066 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.33 
 
 		 915 aa  56.2  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.16 
 
 		 908 aa  54.7  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.1 
 
 		 856 aa  53.9  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  23.6 
 
 		 858 aa  51.6  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.1 
 
 		 858 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  21 
 
 		 781 aa  50.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  26.73 
 
 		 984 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  35.25 
 
 		 1050 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  18.47 
 
 		 803 aa  49.3  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  21.05 
 
 		 909 aa  48.9  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  30.28 
 
 		 1038 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  33.59 
 
 		 1055 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  21.04 
 
 		 919 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  33.94 
 
 		 1134 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 		 1038 aa  45.8  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  32.28 
 
 		 896 aa  45.8  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  29.09 
 
 		 1096 aa  45.8  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.71 
 
 		 855 aa  44.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>