124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0467 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 
250 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  66.94 
 
 
249 aa  320  2e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  66.8 
 
 
256 aa  318  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  48.57 
 
 
245 aa  231  7e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  48.57 
 
 
245 aa  231  7e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  48.98 
 
 
245 aa  222  5e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  50.62 
 
 
248 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  48.96 
 
 
245 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  57.66 
 
 
250 aa  213  2e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  48.98 
 
 
251 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  44.17 
 
 
250 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  45.53 
 
 
248 aa  201  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  43.46 
 
 
279 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  45.34 
 
 
254 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  35.63 
 
 
243 aa  134  1e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.18 
 
 
245 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.98 
 
 
242 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  32.64 
 
 
242 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  34.98 
 
 
242 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  34.98 
 
 
242 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.74 
 
 
242 aa  119  4e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  33.06 
 
 
247 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.97 
 
 
278 aa  117  1e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  34.15 
 
 
242 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.61 
 
 
245 aa  116  4e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.65 
 
 
245 aa  116  4e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  33.88 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  33.88 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.88 
 
 
240 aa  115  7e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.59 
 
 
278 aa  115  7e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  36.44 
 
 
263 aa  115  8e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  34.01 
 
 
261 aa  115  9e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.13 
 
 
288 aa  114  1e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  36.02 
 
 
263 aa  114  1e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  36.02 
 
 
263 aa  114  1e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.02 
 
 
263 aa  114  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  35.59 
 
 
279 aa  113  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  34.5 
 
 
247 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.19 
 
 
244 aa  112  4e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.64 
 
 
252 aa  113  4e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  36.44 
 
 
243 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  35.02 
 
 
243 aa  112  7e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.02 
 
 
244 aa  111  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  34.66 
 
 
288 aa  110  1e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.32 
 
 
253 aa  110  1e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  37.5 
 
 
243 aa  109  4e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.97 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  34.89 
 
 
247 aa  108  8e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.02 
 
 
240 aa  108  8e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  35.63 
 
 
243 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  34.75 
 
 
280 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  35.29 
 
 
287 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  32.63 
 
 
238 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  34.75 
 
 
327 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.03 
 
 
245 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  34.75 
 
 
280 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.65 
 
 
249 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  34.75 
 
 
280 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  34.75 
 
 
280 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.83 
 
 
247 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  34.75 
 
 
318 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  31.28 
 
 
243 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  30.99 
 
 
240 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  34.65 
 
 
229 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  35 
 
 
247 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  35.53 
 
 
231 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  28.76 
 
 
232 aa  99  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  33.94 
 
 
241 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  36.89 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  32.92 
 
 
234 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  32.92 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.56 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  34.4 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  33.69 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  36.16 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  36.16 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  36.16 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5137  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.32 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  35.19 
 
 
219 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  30.23 
 
 
229 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.71 
 
 
247 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  30.99 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  44.22 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  29.11 
 
 
236 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1238  putative racemase  33.33 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205483  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  33.04 
 
 
251 aa  85.1  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  33.8 
 
 
228 aa  84.7  1e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  34.51 
 
 
246 aa  84.7  1e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  33.16 
 
 
246 aa  82.8  4e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  36.84 
 
 
252 aa  80.1  3e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  33.33 
 
 
250 aa  79  8e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  33.94 
 
 
250 aa  77.4  2e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  32.68 
 
 
253 aa  74.3  2e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  26.07 
 
 
259 aa  73.6  3e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  29.5 
 
 
262 aa  72.8  4e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.07 
 
 
226 aa  72.8  5e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  35.21 
 
 
227 aa  72.4  6e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  37.59 
 
 
267 aa  72  9e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  29.46 
 
 
238 aa  71.2  2e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  31.55 
 
 
223 aa  69.3  5e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>