23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0436 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  63.57 
 
 
226 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  47.06 
 
 
354 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  46.13 
 
 
287 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  54.17 
 
 
265 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  50.19 
 
 
263 aa  218  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  49.81 
 
 
267 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  51.35 
 
 
263 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  44.91 
 
 
265 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  38.24 
 
 
267 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  37.12 
 
 
296 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  38.36 
 
 
290 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  36.21 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  41.89 
 
 
269 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  43.7 
 
 
276 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  45.36 
 
 
287 aa  174  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  36.49 
 
 
267 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  50.29 
 
 
189 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  53.75 
 
 
173 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  57.97 
 
 
108 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  56.98 
 
 
101 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  53.25 
 
 
97 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  65.52 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>