24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0401 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0401  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 487 aa  905    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039914  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1737  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  73.85 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00165447  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.67 
 
 		 500 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1393  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.3 
 
 		 491 aa  346  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.92 
 
 		 484 aa  346  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1102  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.49 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0088  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.37 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0214  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 454 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0039  hypothetical protein  29.24 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.304092  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0047  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.75 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0075  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.87 
 
 		 459 aa  96.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.542735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.66 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  26.99 
 
 		 576 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.86 
 
 		 593 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  24.86 
 
 		 593 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  40.79 
 
 		 1888 aa  51.6  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 596 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  29.85 
 
 		 247 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>