More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0338 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  91.53 
 
 		 177 aa  328  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  291  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  291  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  289  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  77.4 
 
 		 177 aa  283  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  72.88 
 
 		 177 aa  264  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  72.32 
 
 		 177 aa  261  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  71.75 
 
 		 177 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  71.19 
 
 		 177 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  70.62 
 
 		 177 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  71.19 
 
 		 177 aa  255  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  71.19 
 
 		 177 aa  253  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  238  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  237  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  233  8e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  230  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  59.32 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  201  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  200  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3792  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3807  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3736  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000312741  decreased coverage  0.00108821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0338  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000132809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  55.42 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  51.41 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 175 aa  184  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0420  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00669543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>