221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0240 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0240  CheW protein  100 
 
 
163 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00382894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5449  CheW protein  81.71 
 
 
164 aa  249  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.470199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2835  CheW domain-containing protein  51.95 
 
 
195 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3061  CheW protein  51.3 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2953  CheW protein  51.25 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  49.31 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3074  CheW protein  38.55 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.442292  hitchhiker  0.00529437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  31.25 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  29.71 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  29.84 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  35.59 
 
 
194 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  27.27 
 
 
178 aa  57.4  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  34.31 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  27.03 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  38.61 
 
 
568 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  35.59 
 
 
191 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  33.33 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  32.77 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  28 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  35.59 
 
 
191 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  28.08 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.11 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  27.2 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  29.17 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  31.37 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  37.82 
 
 
319 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.56 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  29.93 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  31.37 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  24.6 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  29.93 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  23.14 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  29.93 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  37.37 
 
 
531 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  25.81 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  25.81 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.81 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  28.7 
 
 
162 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  23.62 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  29.79 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  30.89 
 
 
533 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  36.46 
 
 
179 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  32.77 
 
 
309 aa  50.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  25.6 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.16 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  30.39 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  28.46 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  33.81 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.17 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  23.29 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  27.08 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  28 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  27.61 
 
 
295 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  25.45 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  43.75 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  30.53 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  27.12 
 
 
308 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  31.01 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  27.12 
 
 
308 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  27.86 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  38.53 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  23.49 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  25 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  29.23 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  30.39 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  21.48 
 
 
180 aa  47.8  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  32.63 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  32.63 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  26.92 
 
 
163 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  32.99 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  27.21 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  23.88 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  26.89 
 
 
309 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  32.63 
 
 
155 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  32.63 
 
 
155 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  30.4 
 
 
155 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  25.19 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  31.93 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  29.77 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  30.23 
 
 
170 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.74 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  25.83 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  29.63 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  25.66 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  30 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  24.83 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  24.83 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  33.64 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  26.67 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  30 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  25.24 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  32.61 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  26.32 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  27.73 
 
 
310 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  30 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  31.53 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  24.22 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  24.32 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  28.37 
 
 
262 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>